vcftools - 在MAC

时间:2018-03-29 19:23:22

标签: bioinformatics vcftools

我正在尝试在mac上安装vcftools。看看以前关于这个问题的帖子,我确定我有Mac OS X开发人员工具(http://www.cnet.com/how-to/install-command-line-developer-tools-in-os-x/)。我遵循官方文件(https://vcftools.github.io/examples.html)中建议的程序。当我从命令行运行时:

  

./ configure.ac

我收到以下错误:

  

./ configure.ac:第4行:意外令牌附近的语法错误[2.63]' ./configure.ac: line 4: AC_PREREQ([2.63])'

如果我尝试:

  

./配置

它说:

  

-bash:./ configure:没有这样的文件或目录

当我用以下内容检查内容时确实没有./configure:

  

LS

任何人都可以指出我做错了什么。我尝试过'homebrew'等资源,但我没有帮助。

非常感谢。

2 个答案:

答案 0 :(得分:-1)

您可以从

下载
git clone https://github.com/vcftools/vcftools.git
cd vcftools

您需要安装autoconf,pkg-config,libtools,automake和zlib。

运行

./autogen.sh

然后

./configure

按照此处的说明操作:https://github.com/vcftools/vcftools

答案 1 :(得分:-1)

我遇到了同样的问题。基本上,您需要安装automake。可以使用

brew install automake

检查https://www.biostars.org/p/306802/