Question

我目前正在尝试根据变量y和x之间的二次模型向我的对数 - 对数图添加非线性正曲线。即使在尝试更改对数质量（x）后，我也总是收到以下消息。

“警告讯息： 1：删除了包含非有限值的29行（stat_smooth）。 2：stat_smooth()中的计算失败：变量长度不同（找到'（重量）'） 3：删除了包含缺失值的29行（geom_point）。“

ggplot(species,aes(x=BodyMass,y= MaleHornLength))+
  geom_point()+geom_smooth(mapping = aes(loglength,logbody),
  data = species, stat = "smooth",method = "lm", 
  formula = species$loglength ~ species$logbody +Time8,    
  se = TRUE,  na.rm = FALSE, show.legend = NA, inherit.aes = TRUE)+
  scale_x_continuous(trans='log',breaks = c(0,5,10,20,50,100,200,300,500))+
  scale_y_continuous(trans='log',breaks = c(0,5,10,20,50,100))+
  labs(x="Male Body Mass (kg)", y="Male Horn Length (cm)")+
  theme(axis.line = element_line(colour = "black"),
        panel.grid.major = element_blank(),
        panel.grid.minor = element_blank(),
        panel.border = element_blank(),
        panel.background = element_blank(),
        axis.text=element_text(size=12, colour = "black"), 
        axis.title=element_text(size=14))

我非常感谢有关此事的任何帮助。感谢您的时间。

Answer 1

关于警告编号2：formula中的geom_smooth参数只能有y作为LHS变量而x作为RHS变量。默认值为y ~ x，但您可以执行此操作，例如y ~ poly(x, 2)或y ~ splines::bs(x, df=4)。该公式是通用的，将使用aes中指定的x和y列。

其他一些事情：

您在[{1}}中不需要data=species，因为您已经在主ggplot调用中提供了geom_smooth。
在你的主要ggplot调用中你有x = BodyMass和y = MaleHornLength，但在data=species你有x = loglength和y = logbody。我无法查看您的数据，因此我无法确定，但这并未反转geom_smooth和geom_point之间的x和y轴映射？
再一次，我无法确定没有看到您的数据，但绘制未进行对数转换的点然后覆盖基于回归曲线的 的数据是否有意义em> log转换？此外，记录变换数据和轴似乎很奇怪。

试图在ggplot中添加非线性正趋势线

1 个答案: