Question

我试图在Jupyter笔记本中编写一些R代码（我也使用python并且希望能够为所有内容使用相同的应用程序），但我遇到了一些问题... < / p>

我在Mac（Yosemite）上。我安装了Anaconda 3，更新了Jupyter，然后安装了RStudio（其中包括R essentials）。安装r-irkernel（我也假设也通过RStudio），版本0.8.11。

当我尝试在Jupyter中启动R笔记本时，它会启动一个内核，然后立即死掉。给出的错误是：

Kernel started: 4275a83e-b2b6-40ef-b161-3a7b2ac57c43
Error: .onLoad failed in loadNamespace() for 'pbdZMQ', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/Applications/anaconda3/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so':
  dlopen(/Applications/anaconda3/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so, 6): Library not loaded: @rpath/libzmq.5.dylib
  Referenced from: /Applications/anaconda3/lib/R/library/pbdZMQ/libs/pbdZMQ.so
  Reason: image not found
Execution halted

请问最好的前进方式是什么？我错过了什么？

谢谢！：）

Answer 1

尝试

conda remove zeromq
conda install zeromq

为我工作。

Answer 2

Alex Mikhalev的answer部分适用于我。但是，它还删除了笔记本和r-essentials。

他们的回答是：

conda remove zeromq
conda install zeromq

但是，我还需要安装以下内容：

conda install notebook
conda install r-essentials

Answer 3

A！其他答案已经解决了Anaconda方法，因此我更笼统地解决了标题Jupyter notebooks for R?。 Anaconda很不错，但总是落后一点。还有另一种运行Jupyter R笔记本的选项，那就是Docker。

Jupyter Docker堆栈

Jupyter Docker堆栈包含在Github和Docker集线器中可用的Jupyter R Notebook here。

您可以尝试

$ docker run --rm -it -p 6780:8888 -v "$PWD":/home/jovyan/ jupyter/r-notebook

在OS X或

中

$ docker run --rm -it -p 6780:8888 -v "$PWD":/tmp jupyter/r-notebook

与其他发行版中一样，或作为操作系统需要设置的路径。

您可能会发现以下有用的线程

R的Jupyter笔记本的Anaconda库错误

3 个答案: