Question

参考以下说明： http://open-babel.readthedocs.io/en/latest/UseTheLibrary/Python_Pybel.html

从http://openbabel.org/wiki/Category:Installation安装Windows 64位版本的Openbabel 2.4.1后，我已经通过pip安装了openbabel和pybel。

>>>pip install pybel
>>>pip install openbabel

我试图以sdf格式找到分子的分子量（文件名是mol1.sdf存在于同一目录中）

我创建的python文件（test.py）如下：

import pybel
mol = pybel.readfile("sdf", "mol1.sdf").next()
print (mol.molwt)

这是命令提示符中发生的事情：

>>> python test.py
Traceback (most recent call last):
File "test.py", line 2, in <module>
mol = pybel.readfile("sdf", "mol1.sdf").next()
AttributeError: 'module' object has no attribute 'readfile'

但是根据上面参考链接中的示例代码，有一个名为＆＃39; readfile＆＃39;读取文件和格式。我错过了什么吗？感谢

Answer 1

我发现我弄错了。事实证明，我没有为该程序安装Python Bindings v1.8。

Answer 2

您安装了“错误的” pybel。对于使用Acaconda的用户，您应该搜索openbabel并安装它。安装openbabel之后，您应该可以使用pybel。不要直接搜索和安装pybel，pybel本身不起作用。您应该执行以下操作： conda uninstall pybel，conda install -c openbabel openbabel

Answer 3

我遇到了同样的错误，后来意识到我安装了错误的 'pybel' 库。如果您使用 conda install pybel 或 pip install pybel 安装了“pybel”，那么您安装了错误的库（即 https://pypi.org/project/pybel/）。您可以使用 help(pybel) 查看包描述，以检查它是否是您期望的包。

要安装正确的“pybel”库，请使用 conda install openbabel 或 pip install openbabel。安装后，使用此命令 from openbabel import pybel 导入“pybel”，现在您拥有了可以使用的正确库。如果仍然出现错误，请考虑使用 openbabel 本身。

我在尝试导入pybel模块时遇到了AttributeError

3 个答案: