用python将遗传密码翻译成蛋白质氨基酸

时间:2018-03-20 16:14:28

标签: python bioinformatics

我需要编写一个程序,询问用户核苷酸序列并将其翻译成氨基酸并使用特定的遗传表。这是我提出的代码,但它无法正常工作。

def sequence(code):

gencode = {
'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M',
'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT':'T',
'AAC':'N', 'AAT':'N', 'AAA':'K', 'AAG':'K',
'AGC':'S', 'AGT':'S', 'AGA':'R', 'AGG':'R',
'CTA':'L', 'CTC':'L', 'CTG':'L', 'CTT':'L',
'CCA':'P', 'CCC':'P', 'CCG':'P', 'CCT':'P',
'CAC':'H', 'CAT':'H', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q',
'CGA':'R', 'CGC':'R', 'CGG':'R', 'CGT':'R',
'GTA':'V', 'GTC':'V', 'GTG':'V', 'GTT':'V',
'GCA':'A', 'GCC':'A', 'GCG':'A', 'GCT':'A',
'GAC':'D', 'GAT':'D', 'GAA':'E', 'GAG':'E',
'GGA':'G', 'GGC':'G', 'GGG':'G', 'GGT':'G',
'TCA':'S', 'TCC':'S', 'TCG':'S', 'TCT':'S',
'TTC':'F', 'TTT':'F', 'TTA':'L', 'TTG':'L',
'TAC':'Y', 'TAT':'Y', 'TAA':'_', 'TAG':'_',
'TGC':'C', 'TGT':'C', 'TGA':'_', 'TGG':'W'}

seq = (seq for seq in code.split())
result = []

for x in seq:
    result.append("".join(seq[char] if x in gencode.keys() else char for char in x))
    return "".join(result)`enter code here`


if __name__ == "__main__":
    code = input("Your sequence: ")
    print (sequence(code))

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

什么不起作用?

在这里,您刚刚定义了函数序列,将代码作为参数。

你需要打电话给它。您可以找到here有关函数的一些信息。