Question

我刚刚开始探索NiftyNet。当我尝试运行autocontext_mr_ct_model_zoo时出现以下错误。

当我运行以下命令时：

  python net_regress.py train \   -c ~/niftynet/extensions/autocontext_mr_ct/net_autocontext.ini \  
 --starting_iter 0 --max_iter 500*

我收到以下错误消息：

ValueError：配置文件中的未知关键字：[error_map] - 所有可能的选择都是[＆＃39;＆＃39;，u＆＃39; loss_border＆＃39;，＆＃39;输出＆＃39;，＆＃ 39;图像＆＃39;，＆＃39;重量＆＃39;，＆＃39;采样器＆＃39;，u＆＃39; cuda_devices＆＃39;，u＆＃39; num_threads＆＃39;，u＆＃39; num_gpus＆＃39 ;，＆＃39; model_dir＆＃39;，u＆＃39; dataset_split_file＆＃39;，u＆＃39; name＆＃39;，u＆＃39; activation_function＆＃39;，u＆＃39; batch_size＆＃39;，u＆＃39; ;腐烂＆＃39;，你＆＃39; reg_type＆＃39;，你＆＃39; volume_padding_size＆＃39;，你＆＃39; window_sampling＆＃39;，你＆＃39; queue_length＆＃39;，u＆＃39; multimod_foreground_type＆＃39; ，u＆＃39; histogram_ref_file＆＃39;，u＆＃39; norm_type＆＃39;，u＆＃39; cutoff＆＃39;，u＆＃39; foreground_type＆＃39;，u＆＃39; normalization＆＃39;，u＆＃39;美白＆＃39;，你＆＃39; normalise_foreground_only＆＃39;，你＆＃39; weight_initializer＆＃39;，u＆＃39; bias_initializer＆＃39;，u＆＃39; weight_initializer_args＆＃39;，u＆＃39; bias_initializer_args＆＃39;，你是优化者＆＃39;，你＆＃39; sample_per_volume＆＃39;，你＆＃39; rotation_angle＆＃39;，你＆＃39; rotation_angle_x＆＃39;，u＆＃39; rotation_angle_y ＆＃39;，u＆＃39; rotation_angle_z＆＃39;，u＆＃39; scaling_percentage＆＃39;，u＆＃39; random_flipping_axes＆＃39;，u＆＃39; lr＆＃39;，u＆＃39; loss_type＆＃39;，你有＆＃39; starting_iter＆＃39;，你＆＃39; save_every_n＆＃39;，你＆＃39; tensorboard_every_n＆＃39;，u＆＃39; max_iter＆＃39;，u＆＃39; max_checkpoints＆＃39;，u＆＃39; validation_every_n＆＃39;，u＆＃39; validation_max_iter＆＃39;，u＆＃39; exclude_fraction_for_validation＆＃39;，u＆＃39; exclude_fraction_for_inference＆＃39;，u＆＃39; inference_iter＆＃39;，u＆＃39; save_seg_dir＆＃39;，u＆＃39; output_interp_order＆＃39;，u＆＃39; border＆＃39;，u＆＃39; csv_file＆＃39;，u＆＃39; path_to_search＆＃39;，u＆＃39; filename_contains＆＃39;，u＆＃39; filename_not_contains＆＃ 39;，u＆＃39; interp_order＆＃39;，u＆＃39; pixdim＆＃39;，u＆＃39; axcodes＆＃39;，u＆＃39; spatial_window_size＆＃39;]。

我不太确定我在这里搞砸了什么，欢迎任何建议。

Answer 1

您下载的源代码看起来已经过时了，您是否正在使用最新版本的NiftyNet运行命令？

pip包目前略显过时，您可以通过运行

获得最新的源代码

git clone https://github.com/NifTK/NiftyNet.git

# installing dependencies from the list of requirements
cd NiftyNet/
pip install -r requirements-gpu.txt

# run command from the source code folder
python net_regress.py train \
  -c ~/niftynet/extensions/autocontext_mr_ct/net_autocontext.ini \
  --starting_iter 0 --max_iter 500

Niftynet：autocontext_mr_ct_model_zoo错误：配置文件中的未知关键字

1 个答案: