使用`plm()`

时间:2018-03-16 21:31:20

标签: r lme4 hierarchical-clustering plm longitudinal

是否可以使用包中的plm()估算重复测量具有嵌套结构的随机效应模型

我知道可以使用包中的lmer()。但是,lmer()依赖于可能性框架,我很想对plm()这样做。

这是我的最小工作示例,受到this question的启发。首先是一些必需的包和数据,

# install.packages(c("plm", "lme4", "texreg", "mlmRev"), dependencies = TRUE)
data(egsingle, package = "mlmRev")

数据集egsingle是一个由1721名学童组成的不平衡小组,分为60个学校,分为五个时间点。有关详细信息,请参阅?mlmRev::egsingle

一些轻量级数据管理

dta <- egsingle
dta$Female <- with(dta, ifelse(female == 'Female', 1, 0))

此外,相关数据的片段

dta[118:127,c('schoolid','childid','math','year','size','Female')]
#>     schoolid   childid   math year size Female
#> 118     2040 289970511 -1.830 -1.5  502      1
#> 119     2040 289970511 -1.185 -0.5  502      1
#> 120     2040 289970511  0.852  0.5  502      1
#> 121     2040 289970511  0.573  1.5  502      1
#> 122     2040 289970511  1.736  2.5  502      1
#> 123     2040 292772811 -3.144 -1.5  502      0
#> 124     2040 292772811 -2.097 -0.5  502      0
#> 125     2040 292772811 -0.316  0.5  502      0
#> 126     2040 293550291 -2.097 -1.5  502      0
#> 127     2040 293550291 -1.314 -0.5  502      0

现在,严重依赖Robert Long's answer,这是我使用包中的lmer()估算重复测量具有嵌套结构的随机效应模型的方法,

dta$year <- as.factor(dta$year)
require(lme4)
Model.1 <- lmer(math ~ Female + size + year + (1 | schoolid /childid), dta)
# summary(Model.1)

我查看了 man 页面中的plm()并且它有一个索引命令index,但它只需要一个索引和时间 ,即index = c("childid", "year"),忽略模型看起来像schoolid

dta$year <- as.numeric(dta$year) 
library(plm)
Model.2 <- plm(math~Female+size+year, dta, index = c("childid", "year"), model="random")
# summary(Model.2)

总结问题

  

如何使用Model.1中的plm()来指定重复测量具有嵌套结构的随机效果模型,如# require(texreg) names(Model.2$coefficients) <- names(coefficients(Model.1)$schoolid) #ugly! texreg::screenreg(list(Model.1, Model.2), digits = 3) # pretty! #> ============================================================== #> Model 1 Model 2 #> -------------------------------------------------------------- #> (Intercept) -2.693 *** -2.671 *** #> (0.152) (0.085) #> Female 0.008 -0.025 #> (0.042) (0.046) #> size -0.000 -0.000 *** #> (0.000) (0.000) #> year-1.5 0.866 *** 0.878 *** #> (0.059) (0.059) #> year-0.5 1.870 *** 1.882 *** #> (0.058) (0.059) #> year0.5 2.562 *** 2.575 *** #> (0.059) (0.059) #> year1.5 3.133 *** 3.149 *** #> (0.059) (0.060) #> year2.5 3.939 *** 3.956 *** #> (0.060) (0.060) #> -------------------------------------------------------------- #> AIC 16590.715 #> BIC 16666.461 #> Log Likelihood -8284.357 #> Num. obs. 7230 7230 #> Num. groups: childid:schoolid 1721 #> Num. groups: schoolid 60 #> Var: childid:schoolid (Intercept) 0.672 #> Var: schoolid (Intercept) 0.180 #> Var: Residual 0.334 #> R^2 0.004 #> Adj. R^2 0.003 #> ============================================================== #> *** p < 0.001, ** p < 0.01, * p < 0.05 ,甚至可能? 3}}包?

以下是两个模型的实际估算结果,

1. void function(int* param)

2. void function(int param[20]) 

3. void function(int param[])

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

基于Helix123's comment我使用包中的plm()重复测量具有嵌套结构的随机效果模型编写了以下模型规范Wallace和Hussain(1969)方法,即random.method = "walhus",用于估计方差分量,

p_dta <- pdata.frame(dta, index = c("childid", "year", "schoolid"))        
Model.3 <- plm(math ~ Female + size + year, data = p_dta, model = "random",
               effect = "nested", random.method = "walhus")

Model.3中看到的结果与Model.1中的估算值完全相同,正如我所料。只有截距略有不同(见下面的输出)。

  

我根据?plm中提供的Baltagi,Song和Jung(2001)的例子编写了上述内容。在Baltagi,Song和Jung(2001) - 示例中,方差分量首先使用Swamy和Arora(1972)估算,即random.method = "swar",其次使用Wallace和Hussain&#39 ; s(1969)。只有Nerlove(1971)变换不会使用Song和Jung(2001) - 数据收敛。而只有Wallace和Hussain(1969) - 方法可以使用egsingle数据集收敛。

     

对此的任何权威参考将不胜感激。我将继续努力。

names(Model.3$coefficients) <- names(coefficients(Model.1)$schoolid) 
texreg::screenreg(list(Model.1, Model.3), digits = 3,
                  custom.model.names = c('Model 1', 'Model 3')) 
#> ==============================================================
#>                                    Model 1        Model 3     
#> --------------------------------------------------------------
#> (Intercept)                           -2.693 ***    -2.697 ***
#>                                       (0.152)       (0.152)   
#> Female                                 0.008         0.008    
#>                                       (0.042)       (0.042)   
#> size                                  -0.000        -0.000    
#>                                       (0.000)       (0.000)   
#> year-1.5                               0.866 ***     0.866 ***
#>                                       (0.059)       (0.059)   
#> year-0.5                               1.870 ***     1.870 ***
#>                                       (0.058)       (0.058)   
#> year0.5                                2.562 ***     2.562 ***
#>                                       (0.059)       (0.059)   
#> year1.5                                3.133 ***     3.133 ***
#>                                       (0.059)       (0.059)   
#> year2.5                                3.939 ***     3.939 ***
#>                                       (0.060)       (0.060)   
#> --------------------------------------------------------------
#> AIC                                16590.715                  
#> BIC                                16666.461                  
#> Log Likelihood                     -8284.357                  
#> Num. obs.                           7230          7230        
#> Num. groups: childid:schoolid       1721                      
#> Num. groups: schoolid                 60                      
#> Var: childid:schoolid (Intercept)      0.672                  
#> Var: schoolid (Intercept)              0.180                  
#> Var: Residual                          0.334                  
#> R^2                                                  0.000    
#> Adj. R^2                                            -0.001    
#> ==============================================================
#> *** p < 0.001, ** p < 0.01, * p < 0.05#>