Question

我想从Python运行R脚本。如果没有＆＃34; + args＆＃34;，以下脚本可以正常工作。任何人都知道传递args的错误是什么？

Python脚本：

import subprocess

Iterations = 10
command = 'C:/Program Files/R/R-3.4.3/bin/Rscript.exe'
path2script = 'C:/Users/a0266997/Documents/PossionDistribution.R'
args = [str(Iterations)]
cmd = [command, path2script] + args
subprocess.Popen(cmd)

R脚本：

myArgs <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
Iterations = myArgs[0]
Iterations

do something in R ....

Answer 1

这是您的代码，其中包含一些适合您的更正。我还将R代码更改为应该可重现的内容（例如，打印到stdout和stderr）。

我将subprocess.Popen(cmd)调用更改为subprocess.Popen(cmd, stdout = subprocess.PIPE, stderr = subprocess.PIPE)，这应解决部分问题。 R代码中也有一个修复程序。

import subprocess

Iterations = 10
command = 'C:/Program Files/R/R-3.4.3/bin/Rscript.exe'
path2script = 'C:/Users/a0266997/Documents/PossionDistribution.R'
args = [str(Iterations)]
cmd = [command, path2script] + args
p = subprocess.Popen(cmd, stdout = subprocess.PIPE, stderr = subprocess.PIPE)
results = p.communicate()

R脚本（代码的修改版本）

这已将myArgs[0]更改为myArgs[1]

myArgs <- commandArgs(trailingOnly = TRUE)
Iterations = myArgs[1]
write(paste0("stdout: ", Iterations),  file = stdout())
write("stderr",                        file = stderr())

我在Mac OS上运行它，它对我有用。至少应该让你开始朝着正确的方向前进，这取决于你需要的细节。

R如何从Python传递参数

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