背景

Question

背景

我正在尝试从云MySQL服务器中提取数据。我刚刚将数据库从共享服务器移动到专用云服务器。在旧的位置上一切正常。新位置需要SSH隧道。

研究/信息：

我发现所有类似的是this SO article。它并没有真正适用，因为我从未使用过localhost。

我可以使用Sequel Pro和MySQL Workbench中的相同凭据成功连接，但我无法让R脚本播放球。

我可以在命令行中连接到mysql。

我不在本地安装了mysql。（除非它附带High Sierra;我不知道。无论如何，如果有一个本地MySQL实例，它就没有运行。）

代码：

这是失败的原因：

con <- dbConnect(RMariaDB::MariaDB(),
                 user = 'soundings_app',
                 password = keyringr::decrypt_kc_pw("Soundings_app"),
                 host = '127.0.0.1',
                 port = 3306,
                 dbname='UFO')

我也尝试将实际密码用作字符串，并得到同样的错误。

错误消息

Error in connection_create(host, username, password, dbname, as.integer(port),  : 
  Failed to connect: Can't connect to MySQL server on '127.0.0.1' (57)

我的唯一猜测

我唯一能想到的是SequelPro＆amp; Workbench都有一个位置可以输入我的私钥（~/.ssh）的位置。

你能解释一下我做错了吗？

更新

我将主机添加到我的./ssh/config文件中，如下所示：

Host XXX.XXX.130.0
  LocalForward 3306 localhost:3306

这导致我的其他连接失败，所以我删除了它。但当我尝试连接〜/ .ssh / config时，Sequel Pro给了我以下信息：

Used command:  /usr/bin/ssh -v -N -S none -o ControlMaster=no -o ExitOnForwardFailure=yes -o ConnectTimeout=10 -o NumberOfPasswordPrompts=3 -i /Users/steves2018air/.ssh/id_rsa -o TCPKeepAlive=no -o ServerAliveInterval=60 -o ServerAliveCountMax=1 ubuntu@XXX.XXX.130.0 -L 49700:127.0.0.1:3306

OpenSSH_7.6p1, LibreSSL 2.6.2
debug1: Reading configuration data /Users/steves2018air/.ssh/config
debug1: /Users/steves2018air/.ssh/config line 1: Applying options for XXX.XXX.130.0
debug1: Reading configuration data /etc/ssh/ssh_config
debug1: /etc/ssh/ssh_config line 48: Applying options for *
debug1: Control socket " none" does not exist
debug1: Connecting to XXX.XXX.130.0 [XXX.XXX.130.0] port 22.
debug1: fd 3 clearing O_NONBLOCK
debug1: Connection established.
debug1: identity file /Users/steves2018air/.ssh/id_rsa type 0
debug1: key_load_public: No such file or directory
debug1: identity file /Users/steves2018air/.ssh/id_rsa-cert type -1
debug1: Local version string SSH-2.0-OpenSSH_7.6
debug1: Remote protocol version 2.0, remote software version OpenSSH_7.2p2 Ubuntu-4ubuntu2.4
debug1: match: OpenSSH_7.2p2 Ubuntu-4ubuntu2.4 pat OpenSSH* compat 0x04000000
debug1: Authenticating to XXX.XXX.130.0:22 as 'ubuntu'

更新II

一时兴起，我尝试将主机从'127.0.0.1'更改为'localhost'，只是为了看看会发生什么，以及是否可以解决问题。略有不同的错误：

Error in connection_create(host, username, password, dbname, as.integer(port),  : 
  Failed to connect: Can't connect to local MySQL server through socket '/tmp/mysql.sock' (2)

仍然没有解决方案或解释 - 你能帮忙吗？

Answer 1

史蒂夫（Steve），感谢您-在进行一些细微改动后，它对我来说非常有效。

我的文件保存在/etc/mysql/mariadb.cnf文件中。

con <- dbConnect(RMariaDB::MariaDB(),
user = "yourusername",
password = "yourpassword",
groups = "destination",
default.file = "/etc/mysql/mariadb.cnf",
host = '127.0.0.1',
port = 3308,
dbname="yourdb_name")

Answer 2

我花了很长时间，但这就是我解决这个问题的方法：

我将此添加到/etc/mysql/.my.cnf：

[destination]
 user=`username`
 port=3308
 proto=TCP

然后我使用以下方法连接到云服务器：

ssh ubuntu@xxx.xxx.xxx.x -L 3308:127.0.0.1:3306

我可以在R之外的终端窗口中运行它，或者我可以在RStudio的终端窗口中运行它 - 无论哪种方式，以下工作：

con <- dbConnect(RMariaDB::MariaDB(),
                 user = '`username`',
                 password = decrypt_kc_pw("`pw_profile_name`"),
                 groups = "destination",
                 default.file = "/etc/mysql/.my.cnf",
                 host = '127.0.0.1',
                 port = 3308,
                 dbname='`db_name`')

无法通过SSH连接R到MySQL服务器

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错误消息

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更新

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