在ggnet中绘制网络

时间:2018-03-11 06:32:08

标签: r networking ggplot2 graph ggnetwork

我使用Igrpah“cluster_optimal”函数创建了一个集群。我可以轻松地绘制不同颜色显示不同聚类的网络。

但是,我可以在“ggnet”中绘制相同的网络群集吗? 我的意思是,是否有任何函数将Igraph生成的网络属性转换为ggnet? 这是我的Igraph代码。这里“se”是任何距离矩阵

s = graph.adjacency(se,mode="undirected",weighted=NULL)
s = simplify(s)
V(s)$label <- subjects

set.seed(5)
layout1 = layout.fruchterman.reingold(s)
com11 = cluster_optimal(s,weights=NULL)
V(s)$color <- com11$membership+1
V(s)$cex=1.5
s <- set_graph_attr(s, "layout1", layout_with_kk(s))
plot(s, layout = layout1)

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