Question

我在运行Linux CentOS 7的笔记本电脑上通过Miniconda安装了Conda。

如果我运行命令conda update conda，我会收到以下错误：

conda update conda
Solving environment: failed

NotWritableError: The current user does not have write permissions to a required path.
  path: /path/to/custom/dir/pkgs/urls.txt
  uid: 1000
  gid: 1000

If you feel that permissions on this path are set incorrectly, you can manually
change them by executing

  $ sudo chown 1000:1000 /path/to/custom/dir/pkgs/urls.txt

In general, it's not advisable to use 'sudo conda'.

我不知道如何解决这个问题;我也问过Bioconda GitHub page，但是没有人回复。

有关如何解决此问题的任何建议？感谢

Answer 1

这在conda问题＃7267（https://github.com/conda/conda/issues/7267）中进行了讨论。

您可能已使用sudo登录，也许以sudo -u davide bash身份登录？

如果是这样，那么以下命令将显示SUDO_COMMAND作为用于成为用户的命令，以及SUDO_USER，SUDO_UID和SUDO_GID：

$ set | grep SUDO

您可以改为使用sudo su - davide来获得没有SUDO定义的干净上下文。

在通过ansible管理共享的conda环境时，我遇到了相同的问题。我的解决方案是使用以下内容作为conda程序包所有者：

- name: update conda environment
  command: conda update -y --all
  become: yes
  become_user: conda
  become_method: su

在群集上共享anaconda安装是否是一个好主意。

conda，Linux CentOS 7上的“解决环境：失败”错误

1 个答案: