背景
这是R的“microbenchmark”包:
https://cran.r-project.org/web/packages/microbenchmark/index.html
reference manual中的第一行表示它是为“精确计时功能”而构建的。
这个问题的一个问题是内在的computer-time vs. computer-memory trade-off。有些解决方案是内存密集型的,但速度很快。有些是CPU密集型的,但占用的内存非常小。
问题:
我如何同时,以及良好的分辨率,基准/微基准不仅执行时间,而且在R执行期间使用内存?
答案 0 :(得分:3)
迟到总比没有好:您可以使用bench::mark()
来衡量代码(以及更多变量)的时间和内存使用情况。
即,(摘自?mark
的帮助页面)
library(bench)
dat <- data.frame(x = runif(100, 1, 1000), y=runif(10, 1, 1000))
mark(
dat[dat$x > 500, ],
dat[which(dat$x > 500), ],
subset(dat, x > 500)
)
#> # A tibble: 3 x 6
#> expression min median `itr/sec` mem_alloc `gc/sec`
#> <bch:expr> <bch:tm> <bch:tm> <dbl> <bch:byt> <dbl>
#> 1 dat[dat$x > 500, ] 21.7µs 23.6µs 40663. 4.15KB 89.7
#> 2 dat[which(dat$x > 500), ] 22.2µs 24.1µs 40228. 2.77KB 92.7
#> 3 subset(dat, x > 500) 36µs 39.2µs 23867. 20.12KB 86.2
由reprex package(v0.3.0)于2020-03-02创建