是否可以直接在类tbl_sql(或tbl_dbi)上运行SQL查询?

时间:2018-02-11 08:48:57

标签: r dplyr tibble rsqlite dbplyr

示例代码:

library(DBI)
library(RSQLite)

# will require more details (like user, password, host, port, etc.)
con <- dbConnect(RSQLite::SQLite(), ":memory:")
data(USArrests)
dbWriteTable(con, "USArrests", USArrests)
dbListTables(con)

d0 <- tbl(con, "USArrests")
dbGetQuery(d0, "select * from USArrests")
dbGetQuery(d0, "select * from d0")

返回:

Error in (function (classes, fdef, mtable)  : 
  unable to find an inherited method for function ‘dbGetQuery’ for signature ‘"tbl_dbi", "character"’

显然我可以在con上使用dbGetQuery,但是想知道是否有办法让它直接在d0上运行。

感谢。

3 个答案:

答案 0 :(得分:2)

一方面,tbl()函数是SELECT * FROM Table类型的SQL语句,它在DBMS上运行,并且从数据库服务器检索数据需要像collect()这样的拉函数。另一方面,函数dbGetQuery()是使用SQL查询将数据检索到R会话中的。两者都需要连接到服务器和语句,但第一个使用SQL转换创建语句,另一个是编写SQL查询的用户。

为了说明我将在postgreSQL DBMS中使用时态表tmp

# Example on postgreSQL
library(tidyverse)
library(dbplyr)
library(RPostgreSQL)
library(DBI) # This is loaded with RPostgreSQL package

con <- dbConnect(PostgreSQL(), 
                 dbname="test",
                 host="localhost",
                 port=5432,
                 user="user",
                 password="pass")

到PostgreSQL服务器的虚拟数据

date <- data_frame(Col1 = c("20180212", "20180213"),
                   Col2 = c("A", "B"))
dbWriteTable(con, "tmp", date, temporary = TRUE)

使用tbl()功能

tbl(con, "tmp") %>% show_query()

#><SQL> 
#>SELECT * 
#>FROM "tmp"

tbl(con, "tmp") %>% 
  mutate(date = to_date(Col1, "YYYYMMDD")) %>%
  show_query()

#><SQL>
#>SELECT "row.names", "Col1", "Col2", TO_DATE("Col1", 'YYYYMMDD') AS "date"
#>FROM "tmp"

tbl(con, "tmp") %>% 
  mutate(date = to_date(Col1, "YYYYMMDD")) %>% #this works on DBMS
  collect() %>% #This retrive to R session
  str()

#>Classes ‘tbl_df’, ‘tbl’ and 'data.frame': 2 obs. of  3 variables:
#> $ row.names: chr  "1" "2"
#> $ Col1     : chr  "20180212" "20180213"
#> $ Col2     : chr  "A" "B"
#> $ date     : Date, format: "2018-02-12" "2018-02-13"

使用dbGetQuery()功能

dbGetQuery(con, "SELECT * FROM tmp") %>% 
  str()

#>'data.frame': 2 obs. of  3 variables:
#> $ row.names: chr  "1" "2"
#> $ Col1     : chr  "20180212" "20180213"
#> $ Col2     : chr  "A" "B"

dbGetQuery(con, "SELECT * FROM tmp") %>%
  mutate(date = as.Date(Col1, format = "%Y%m%d")) %>% #This works on R session
  str()

#>'data.frame': 2 obs. of  4 variables:
#> $ row.names: chr  "1" "2"
#> $ Col1     : chr  "20180212" "20180213"
#> $ Col2     : chr  "A" "B"
#> $ date     : Date, format: "2018-02-12" "2018-02-13"

结论

tbl()函数在R编程中高于dbGetQuery()。考虑重新设计您的代码链,了解这些功能之间的差异以及这些功能的最佳用途。

答案 1 :(得分:1)

不,您不能以dplyr方式使用DBIConnection,只能使用d0

此外,您的第一个查询是冗余查询,USArrests已经代表dplyr数据,第二个查询是无意义的。

dplyr使用了一种不同的方法,它使用d0 %>% filter(Murder > 10) %>% show_query() 动词并创建SQL查询:

def regex_parameters1():
    a = re.compile(r're1')
    b = re.compile(r're2')
    c = re.compile(r're3')
    d = re.compile(r're4')
    e = re.compile(r're5')
test = re.search(regex_parameters1, text)
for i in test
  if i is not None:
     print(i.group())

答案 2 :(得分:1)

好的,查看str有助于了解如何使用以下命令访问所需的元素:

  con <- d0$src$con
  db_name <- db_list_tables(con)[1]