并行R计算时相同函数的结果不同

Question

我在Windows 10下使用 system2 功能与并行库调用外部批处理时遇到问题，我的函数执行外部程序来读取二进制文件（必须是与示例相同的文件夹中的内容）。问题是myfunction在调用简单函数时返回正确的行数（35行），但在并行化时返回少4行（31行）。 Here you can find an example with all files （https://www.dropbox.com/sh/kdoqdv5uh1rhr98/AAB86TpgVjVlFQRsTOvmZoipa?dl=0） 我的功能如下：

运行功能

a

我的功能定义为：

file_to_read<-"crop@seasonal$d.UED"
library(parallel)    
cl <- makeCluster(2)
clusterEvalQ(cl, library(base))
seq_along_path_index<-seq_along(all_cells$V1)
list_results<-parLapply(cl,file_to_read,
                      myfunction)) #return 31
stopCluster(cl)
#simple call
list_results2<-myfunction(file_to_read) #return 35

由于

Answer 1

这可能来自数据框也是列表的事实。 例如，当您使用unlist(list(iris, iris))时，您将获得大小为1500的数字向量。 相反，如果您想要包含所有数据框列的列表，请尝试将unlist与recursive = FALSE一起使用，或者如果您希望附加数据框，请使用do.call("rbind", list(iris, iris))代替unlist(list(iris, iris))按行。