我的环境中有一个特定的错误,因此无法将Rmarkdown文件始终编织为HTML,Word文档或PDF。编织能力因文件类型而异。
错误是:
Segmentation fault/access violation in generated code
Error: pandoc document conversion failed with error 1
直到一周前,我能够在同一环境中编织所有三种文件类型,因此这是一个相对较新的错误。我的环境的高级规范是:
作为编织能力不一致的一个例子,我在RStudio中创建了一个新的.Rmd文件,它创建了summary(cars)
和plot(pressure)
等熟悉的标准模板。我没有改变任何东西关于它。我能够成功地将它编织成HTML一次,Word .docx一次,然后我尝试编织成PDF并得到上面的错误。然后我回去试图编织HTML和Word并收到错误,即使没有从原始编织改变。这只是行为类型的一个例子。不同的文档表现不同。
要进行故障排除,我重新安装了R和RStudio(我相信pandoc出现了RStudio安装,所以我也有效地重新安装了pandoc)。重新安装没有帮助。我已经尝试清除Knitr Cache了。那也行不通。我浏览了SO和互联网,发现了一些与Glasgow-Haskell编译器有关的类似错误,但我不知道那是什么,如果它是问题的根源。
以下是抛出错误的.Rmd文件示例:
---
title: "Untitled"
author: "Vypa"
date: "February 8, 2018"
output:
html_document: default
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```{r setup, include=FALSE}
knitr::opts_chunk$set(echo = TRUE)
```
## R Markdown
This is an R Markdown document. Markdown is a simple formatting syntax for authoring HTML, PDF, and MS Word documents. For more details on using R Markdown see <http://rmarkdown.rstudio.com>.
When you click the **Knit** button a document will be generated that includes both content as well as the output of any embedded R code chunks within the document. You can embed an R code chunk like this:
```{r cars}
summary(cars)
```
## Including Plots
You can also embed plots, for example:
```{r pressure, echo=FALSE}
plot(pressure)
```
Note that the `echo = FALSE` parameter was added to the code chunk to prevent printing of the R code that generated the plot.
这是完整的控制台错误:
Segmentation fault/access violation in generated code
Error: pandoc document conversion failed with error 1
In addition: Warning message:
running command '"C:/Users/Vypa/RStudio/bin/pandoc/pandoc" +RTS -K512m -RTS tst.utf8.md --to html --from markdown+autolink_bare_uris+ascii_identifiers+tex_math_single_backslash --output tst.html --smart --email-obfuscation none --self-contained --standalone --section-divs --template "C:\Users\Vypa\Documents\R\R-3.4.3\library\rmarkdown\rmd\h\default.html" --no-highlight --variable highlightjs=1 --variable "theme:bootstrap" --include-in-header "C:\Users\Vypa\AppData\Local\Temp\RtmpI9Gxsx\rmarkdown-str5db029544a23.html" --mathjax --variable "mathjax-url:https://mathjax.rstudio.com/latest/MathJax.js?config=TeX-AMS-MML_HTMLorMML"' had status 1
Execution halted
任何帮助或想法都将不胜感激。
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最近在Win10上安装R&RStudio后遇到相同的问题。 Pandoc问题出现在以前免费的.rmd文件的编辑和编织中。
在
安装RStudio的最新预览版后解决。