我正在尝试找到一种新的方法来聚类序列数据。我实现了我的方法,并获得了准确率。现在我应该将它与可用的方法进行比较,看看它是否像我预期的那样工作。
是否有可能告诉我生物信息学领域最着名的方法是什么?与Python中的那些方法相对应的包是什么?我是一名工程师,不知道这个领域中最准确的方法,我应该将我的方法与它们进行比较。
答案 0 :(得分:2)
两种常用的方法是:
两者都是命令行工具,用C ++编写(我认为)
答案 1 :(得分:1)
这还取决于您需要使用哪种工具的问题(数据缩减,otu聚类,制作树等)。这些天来,您会看到群集工具的变化,该变化使用了更加动态的方法而不是固定的相似性临界值。 示例:
固定群集: