Pandas to_hdf并导入到Matlab

时间:2018-02-05 09:57:37

标签: python matlab pandas import hdf5

我遇到了一个奇怪的问题,找不到我做错的事情:

在Python中,我有一个简单的矩阵作为pandas dataframe(6000 x 1500矩阵)。正如我想将其读入Matlab,我将数据帧保存为HDF5,如下所示:

 df.to_hdf("output.hdf","mytable", format="table")

保存工作正常,并使用pd.read_hdf回读Python,也可以正常工作。但是当我尝试将相同的文件导入Matlab时,如下所示:

 data = h5read('output.hdf','/mytable')

我刚收到错误:

 H5Dopen2    not a dataset

我在某处读到在数据集名称('/ mytable')中留一个空格,但只返回“对象不存在”错误。

对于可能出现的问题的任何提示都非常感谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

在Matlab中使用h5info,我发现在Matlab中我需要明确指定" table"在数据集中:

   data = h5read('output.hdf','/mytable/table')

至少这会导入HDF5。奇怪的是,我没有在任何地方看到过这个。

但是,现在似乎某些行未正确导入,我需要进一步调查。