概述

Question

是否可以使用R从Github下载整个存储库？我想访问的这些文件不是.csv文件（大多数教程都教）。它们是.r和.rmd文件的混合，我想单独或一次性读入R。谢谢:)）

Answer 1

概述

您可以使用R分三个步骤从GitHub下载整个存储库：

从GitHub repository of interest上的Clone or download按钮复制.zip网址。请务必复制Download ZIP的链接地址，而不是HTTPS网址。

注意：此步骤假定您对感兴趣的GitHub存储库的master分支感兴趣。如果不是这种情况，be sure to navigate to the branch you are interested in downloading。

将.zip网址粘贴到download.file()的url参数中，以下载感兴趣的.zip文件。由于这是一个GitHub存储库，因此为destfile参数指定与感兴趣的存储库相同的名称（在本例中为destfile = "meetingsR-master"）会很有帮助。 destfile参数名称的“-master”部分来自声明您要下载的感兴趣的存储库的分支名称。
使用unzip()解压缩下载的.zip文件。

可重复的示例

在使用下面的代码时，请注意更改文件路径。

# set working directory so I know where the .zip file will be located
setwd(dir = "/some/path/")

# download a .zip file of the repository
# from the "Clone or download - Download ZIP" button
# on the GitHub repository of interest
download.file(url = "https://github.com/jumpingrivers/meetingsR/archive/master.zip"
                                   , destfile = "meetingsR-master.zip")

# unzip the .zip file
unzip(zipfile = "meetingsR-master.zip")

# set the working directory
# to be inside the newly unzipped 
# GitHub repository of interest
setwd(dir = "/some/path/meetingsR-master/")

# examine the contents
list.files()
# [1] "_book"                                
# [2] "_output.yml"                          
# [3] "01-events.Rmd"                        
# [4] "02_useR_groups_aaa.Rmd"               
# [5] "02_useR_groups_asia.Rmd"              
# [6] "02_useR_groups_europe.Rmd"            
# [7] "02_useR_groups_middle_east_africa.Rmd"
# [8] "02_useR_groups_north_america.Rmd"     
# [9] "02_useR_groups_oceania.Rmd"           
# [10] "02_useR_groups_south_america.Rmd"     
# [11] "03-Rladies.Rmd"                       
# [12] "css"                                  
# [13] "deploy.sh"                            
# [14] "DESCRIPTION"                          
# [15] "docs"                                 
# [16] "index.Rmd"                            
# [17] "inverse.png"                          
# [18] "logo.png"                             
# [19] "Makefile"                             
# [20] "NAMESPACE"                            
# [21] "R"                                    
# [22] "README.md"                            
# [23] "Rmeetings.Rproj"

# end of script #

Answer 2

我发现此问题包含rstudio标记。您可以通过选择 file - ＆gt;来使用rstudio（并避免使用命令行） 新项目 - ＆gt; 版本控制 - ＆gt; git 并在Repository URL字段中输入所需Github存储库的地址。

点击Create Project按钮后，rstudio将下载存储库的内容，创建新项目，并将工作目录更改为新项目。

请参阅http://happygitwithr.com/rstudio-git-github.html#clone-the-new-github-repository-to-your-computer-via-rstudio

Answer 3

您可以通过安装软件包usethis使用R从GitHub下载整个存储库：

install.packages（'usethis'）

从感兴趣的GitHub存储库上的“克隆”或“下载”按钮复制.zip URL。确保从下载ZIP复制链接地址，而不是从HTTPS URL复制。

例如，我要下载此repository。我将从下载ZIP（https://github.com/cwickham/purrr-tutorial.git）复制链接地址，并将其粘贴到usethis::use_course()，然后删除 .git ，并用 / archive / master替换。压缩

usethis :: use_course（'https://github.com/cwickham/purrr-tutorial/archive/master.zip'）

然后，您按照R出现的提示问题，关于文件的保存位置。

如何使用R从Github下载整个存储库？

3 个答案:

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可重复的示例