Question

我正在运行MacOS 10.13（High Sierra），最近更新为R版本3.4.3和R studio版本1.1.419。由于某种原因，rJava包没有工作...在stackoverflow上尝试了几个修复，没有任何作用。此外，摘要包将不会加载，所以我不能再使用ggplot2。有什么建议吗？

Java错误：

    > library("rJava", lib.loc="/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library")
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so':
  dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: @rpath/libjvm.dylib
  Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
  Reason: image not found

摘要包错误：

    > library("rJava", lib.loc="/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library")
Error: package or namespace load failed for ‘rJava’:
 .onLoad failed in loadNamespace() for 'rJava', details:
  call: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  error: unable to load shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so':
  dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: @rpath/libjvm.dylib
  Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
  Reason: image not found

Answer 1

新的Mac OSX版本记录了在R / RStudio中弄乱Java路径的问题（参见here）。看起来这就是你在这里遇到的情况。

如果您查看我上面链接的问题，希望您能找到一个可以重置路径的解决方案;以下两个命令对我有用。

dyn.load('/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_66.jdk/Contents/Home/jre/lib/server/libjvm.dylib')

或

sudo ln -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib

Answer 2

我不知道rJava的问题，但digest刚刚更新，所以如果你尝试安装二进制文件，它可能还没有编译和构建。如果发生这种情况（这有点像竞争条件/滞后），您可以尝试重新安装表单来源：

install.packages("digest", type = "source")

MacOS High Sierra和R软件包之间的冲突

2 个答案: