“读取太多gml文件时，”运行错误：fdopen（）意外失败“

Question

我正在阅读使用igraph和python的太多GML文件（几千个）。 在运行代码的某个时刻，我得到以下运行时错误：

RuntimeError: fdopen() failed unexpectedly

我花了很多时间试图了解原因，但我没有发现任何有用的东西。

根本原因来自此处的代码https://github.com/igraph/python-igraph/blob/master/src/filehandle.c#L231

我使用的代码如下。在阅读了几百个文件之后，它在阅读GML的路线上打破了。

gmls= []
for f in sorted(glob.glob('path_to_gmls'), key=os.path.getsize):
    g = Graph.Read_GML(f)
    gmls.append(g)

更新： 我在Mac上尝试了相同的代码，它运行得很好。问题出在Windows上。

UPDATE2： 我使用以下代码测试了包，它运行没有问题。

import igraph.test
igraph.test.run_tests()

Answer 1

你内存不足吗？ （我不是python程序员）。如果同时打开多个文件，那么这些打开句柄的缓冲区可能会占用大量内存。此外，您似乎正在将文件的内容附加到内存数组中。如果内容再次变大，则可能是内存问题。