Question

我有一个错误，我有点难以理解。我有一个脚本，它使用biopython来查询数据库。有时候，biopython无法找到我们正在寻找的东西，并且会抛出HTTPError。但是我无法捕获HTTPError，因为我收到以下错误消息：

HTTPError：HTTP错误404：未找到

在处理上述异常期间，发生了另一个异常：

NameError Traceback（最近一次调用   最后）in（）        51 UniProt =文本[索引+9：索引+15]        52 uniprot_IDs [bigg_ID] = UniProt   ---＆GT; 53除HTTPError外：        54如果err.code =='404'：        55 uniprot_IDs [biGG_ID] =无

NameError：未定义名称“HTTPError”

如何首先抛出未定义的错误？我错过了什么？

这是相关代码：

from Bio.KEGG import REST, Enzyme
from DataTreatment import openJson, write

...

try:
    ec_number = some_string
    text = REST.kegg_get('ec:'+ec_number).read()

...

except HTTPError:
    if err.code == '404':
        a_dict[a_key] = None

Answer 1

您需要导入HTTPError类。如果您已经导入，那么请确保您使用的是正确的。您可以尝试捕获一般的异常并使用类型（ex）来找出它是什么并导入正确的类型。

Answer 2

您需要导入HTTPError类，试试这个;

在代码顶部添加

from urllib.error import HTTPError

来源：Entrez._HTTPError vs. Entrez.HTTPError (via Entrez.efetch)

脚本引发HTTPError，但无法捕获

2 个答案: