无法从Xcode 9中的Project Navigator中删除我的项目副本

Question

我是iOS开发的新手。最近，我在网上下载了一个开源项目代码，并使用我自己的逻辑和代码对其进行了更多的增强。现在，我想重命名它，为此，我一步一步地遵循这个主题：How do I completely rename an Xcode project (i.e. inclusive of folders)?

当我运行项目时，它显示缺少视图控制器错误。所以，我已经更新了每个视图控制器到新更新的项目文件夹（VC的路径）的路径。现在，错误消失了，应用程序工作正常，但我在导航器中获得了2个项目副本。当我试图删除第二个项目时，它删除了两个项目。我不知道发生了什么事。

[错误图片]