Question

我正在使用R中的数据框，开头如下：

   > head(renamed.Mc.Cd.Ni[2:6])
   s_MC13_B2_Cd.Ni s_MC13_B3_Cd.Ni s_MC13_B4_Cd.Ni     GENE_ID
   9.854759       10.216916        9.722329     GENE:JGI_V11_100009        
   7.863938        8.075640        7.894878     GENE:JGI_V11_100009
   9.448034        9.177245        9.053654     GENE:JGI_V11_100036
   9.333245        9.208673        9.159947     GENE:JGI_V11_100036
   9.360540        9.374757        9.273236     GENE:JGI_V11_100036
   8.983222        9.023339        9.112987     GENE:JGI_V11_100044

正如您所看到的，我有三个柱子，它们可以在治疗时为3种不同的水蚤提供基因表达值。最后一列代表表达的基因。然而，由于使用了多个探针，每个基因存在多于一行。如何获得每个水蚤的每个基因的平均值（第1-3列）？

例如，对于三个水蚤（第1列至第3列）中的每一个，我想要第4列中显示的每个基因的总体平均基因表达。我不能手动操作，因为我有超过60,000个基因探针表达值。 / p>

提前谢谢！

Answer 1

你的问题似乎是一个直截了当的群体问题，有几个例子已经在SO ...所以这是一个重复，但是，这是一个整洁的解决问题的方法。

{{1}}

如何获得R中每个基因的每个柱的平均值？

1 个答案: