Question

我在python中编写了一个代码，用于将dicom（.dcm）数据转换为csv文件。但是，如果我在数据库目录中多次运行代码，则数据会自动丢失/删除。我尝试在“回收站”中搜索但找不到已删除的数据。我不知道数据出错的过程。

我的代码有什么问题吗？任何建议都非常感谢。

这是我的代码：

import xlsxwriter
import os.path
import sys
import dicom
import xlrd
import csv


root = input("Enter Directory Name: ")
#path = os.path.join(root, "targetdirectory")
i=1

for path, subdirs, files in os.walk(root):
    for name in files:

        os.rename(os.path.join(path, name), os.path.join(path,'MR000'+ str(i)+'.dcm'))
        i=i+1


dcm_files = []
for path, dirs, files in os.walk(root):
    for names in files:
        if names.endswith(".dcm"):
            dcm_files.append(os.path.join(path, names))

print (dcm_files)

with open('junk/test_0.csv', 'w', newline='') as csvfile:
        spamwriter = csv.writer(csvfile, delimiter=',',
                                quotechar='|',
                                quoting=csv.QUOTE_MINIMAL)

        spamwriter.writerow(["Folder Name","File Name", "PatientName",
                             "PatientID", "PatientBirthDate","SliceThickness","Rows"])

        for dcm_file in dcm_files:
            ds = dicom.read_file(dcm_file)
            fileName = dcm_file.split("/")
            spamwriter.writerow([fileName[1],fileName[2], 
                                 ds.get("PatientName", "None"), 
                                 ds.get("PatientID", "None"), 
                                 ds.get("PatientBirthDate", "None"), 
                                 ds.get("SliceThickness", "None"),
                                 ds.get("Rows", "None")])

Answer 1

您有以下情况：

第一次迭代后，您以文件结束：MR0001.dcm，MR0002.dcm，MR0003.dcm ...在第二次迭代中，有以下更改：

os.rename('some_file',  'MR0001.dcm')
os.rename('MR0001.dcm', 'MR0002.dcm')
os.rename('MR0002.dcm', 'MR0003.dcm')
os.rename('MR0003.dcm', 'MR0004.dcm')
...

所以最后只有一个文件＆＃39; MR0004.dcm＆＃39;。

在重命名后面添加以下行：

print( os.path.join(path, name), '-->', os.path.join(path,'MR000'+ str(i)+'.dcm'))

然后你会看到，文件被重命名的是什么。

编译代码时，进程会自动删除原始文件

1 个答案: