Question

我有超过100000个文件。

例如，我在下面提到了3个文件

bcbb79d8-1d4a-4fbb-b16c-4df86839773e.htseq.counts.gz
bcdc68db-c874-4097-9c46-b06e331caaf5.htseq.counts.gz
bd4b6975-90d9-43f8-aadc-344d04644822.htseq.counts.gz

我有一个名为key.txt的文本文件，其中包含以下信息。

File Name                                                 ID
bcbb79d8-1d4a-4fbb-b16c-4df86839773e.htseq.counts.gz    TCCC-06-0210
bcdc68db-c874-4097-9c46-b06e331caaf5.htseq.counts.gz    TCHA-27-2519
bd4b6975-90d9-43f8-aadc-344d04644822.htseq.counts.gz    TCHU-76-4929

我想只获取其名称在密钥中的那些文件，将它们移动到新文件夹并将其名称更改为ID。

Answer 1

我想更多的写作而不是评论会有所帮助。要采取的方法是从fname中的每一行读取文件名（id）和ID（key.txt），然后验证 fname是一个文件并且确实存在，然后将"$fname"中的文件移动到您需要的任何"/path/to/move/to/$id"。

例如：

#!/bin/bash

## read each line into variables fname and id (handle non-POSIX eof)
while read -r fname id || [ -n "$fname" ]; do
    ## test that "$fname" is a file, and if so, move to destination
    [ -f "$fname" ] && mv "$fname" "/path/to/move/to/$id"
done < key.txt

（注意：一个POSIX文件结尾（eof）只是最后一行末尾的最后'\n'。有些编辑不执行它并且它会导致您的读取错过最后一行数据，除非您检查"$fname"是否填充了数据（非空） - [ -n "$fname" ]添加到{{1}的末尾}）

您正在为循环提供white read -r ...的重定向。 key.txt循环的每次迭代都会将while中的新行读入变量key.txt和fname（默认内部字段分隔符上的分词（id）。在读取并分离到IFS和fname之后，您只需验证id是否包含有效的文件名（在当前工作目录中），然后{ {1}}您想要的文件。

您应该在包含这些文件的目录中执行该脚本，或者将相对或绝对文件名附加到它们所在的位置$fname。

示例

这是一个简短的例子，可以帮助解决问题：

mv脚本：

"$fname"

move_rename.sh文件：

$ cat move_rename.sh #!/bin/bash ## read each line into variables fname and id (handle non-POSIX eof) while read -r fname id || [ -n "$fname" ]; do ## test that "$fname" is a file, and if so, move to destination [ -f "$fname" ] && mv "$fname" "dest/$id.txt" done < key.txt

脚本执行前的文件位置。（dest）是要移动到的目录。（即key.txt输出不是$ cat key.txt File Name ID bcbb79d8-1d4a-4fbb-b16c-4df86839773e.htseq.counts.gz TCCC-06-0210 bcdc68db-c874-4097-9c46-b06e331caaf5.htseq.counts.gz TCHA-27-2519 bd4b6975-90d9-43f8-aadc-344d04644822.htseq.counts.gz TCHU-76-4929，ls -one是'L（小写））

ls -L(lowercase)

执行脚本

ls -al

执行后的工作目录内容

$ ls -1 dest bcbb79d8-1d4a-4fbb-b16c-4df86839773e.htseq.counts.gz bcdc68db-c874-4097-9c46-b06e331caaf5.htseq.counts.gz bd4b6975-90d9-43f8-aadc-344d04644822.htseq.counts.gz key.txt move_rename.sh $ ls -al dest total 16 drwxr-xr-x 2 david david 4096 Jan 17 20:05 . drwxr-xr-x 16 david david 12288 Jan 17 20:05 ..

执行后$ bash move_rename.sh的内容。

$ ls -1 dest key.txt move_rename.sh

如何根据键移动特定文件并重命名它们

1 个答案: