Question

我对conda环境和jupyterhub之间的关系有点困惑。

正如jupyterhub文档所说它可以从conda安装。所以可以使用一些conda环境（例如环境“root”）并从中做“conda install jupyterhub”。

在同一环境中“活着”jupyter。在此环境中安装nb_conda可以在笔记本中选择内核和其他conda环境。

我的问题是关于像nbextensions和ipywidgets这样的软件。它们应该在哪里？在与jupyterhub相同的环境中或在环境中对应新笔记本？

Answer 1

conda和jupyter之间的关系可能令人困惑。将conda视为您的环境，将jupyter视为任何其他软件包。您可以用来启动流程然后提供服务的软件包。

要回答您的问题，应将它们安装在conda环境中。不幸的是，它要复杂得多。这些扩展将对所有用户可用。我还没有亲自测试过在不同环境中具有更多扩展名的单个用户（如果可能的话，但如果可以的话，将更新答案）。

If it helps, this is what the docs have to say for the matter:

要安装jupyter_contrib_nbextensions笔记本扩展，需要三个步骤。首先，需要安装Python pip软件包。然后，笔记本扩展本身需要复制到Jupyter数据目录。最后，可以通过使用内置的Jupyter命令来启用已安装的笔记本扩展程序，或者通过使用jupyter_nbextensions_configurator服务器扩展程序（作为此存储库的依赖项进行安装）来更方便地启用该扩展程序。

Assuming you installed the extensions via conda：

conda install -c conda-forge jupyter_contrib_nbextensions

然后使用--sys-prefix，这很好。从文档中：

--sys-prefix安装到python的sys.prefix中，对于在虚拟环境（例如conda）中的实例很有用。

因此，要添加扩展名，该过程应如下所示：

$ sudo su -
$ pip install fileupload
$ jupyter nbextension install --sys-prefix --py fileupload
$ jupyter nbextension enable fileupload --py --sys-prefix

由于标题是关于conda环境的问题，因此我也将对此进行介绍。我已经在Ubuntu 18.04LTS上测试了这些方法。

很多时候，您将希望允许用户共享用户创建的环境，而永远无法访问root特权。我见过两个不错的选择（如果您知道其他方法，请发表评论）：1）共享环境2）从需求文件复制环境。别忘了，您还必须将环境添加为内核。

方法1-共享环境

在共享位置创建环境，然后让两个用户将其添加为内核。

conda create -p /home/envs/test --clone root

可以克隆root以复制根env，或为基本环境的基础。 / home / envs / test将在“ envs”目录中创建一个“测试”环境。确保envs对将要使用这些文件的用户具有所有必要的权限。

从那里以另一个用户的身份，只需将环境添加为内核即可。

$ sudo su - <user-to-install-kernel-to>
$ conda activate <test>
$ python -m ipykernel install --user --name test \
         --display-name "Python (test)"

注意..我相信我必须手动更新kernelspec才能使其指向正确的python环境?‍♂️

方法2

或者，只需创建环境的副本

$ conda env export --name test > environment.yml
$ sudo su - customer
$ conda env create --name cust-env-copy --file environment.yml
$ python -m ipykernel install --user --name cust-env-copy \
         --display-name "Python (test)"

jupyterhub和conda环境

1 个答案:

方法1-共享环境

方法2