最有效的方法是将字符串分解为R中相等长度的子字符串

Question

我有大约300万个可变长度的序列，我想打破重叠的子串。目前，这就是我这样做的方式：

EmptyBase

最有效的方法是什么？如果它可以并行化会很好。

谢谢！

Answer 1

不确定最有效的方法，但我们可以使用mclapply中的parallel来并行化它。

  subsequences <- mclapply(sequences, function(x){
  substring(
    x, seq(from = 1, to = (nchar(x) - n + 1)), seq(from = n, to = nchar(x)))
  })
names(subsequences) <- sequences