color deconvolution:使用带有scikit-image的Image-J自定义染色矩阵

时间:2018-01-15 09:53:24

标签: python image-processing scikit-image imagej

我想将scikit-image "stain_separation"方法与自定义染色矩阵一起使用。 我使用了Image-J的color deconvolution插件来创建自定义矩阵。 当我使用这些值时,污点分离根本不起作用(在devonvolution之后所有通道看起来都相同。当查看内置的染色矩阵,例如"hdx_from_rgb"时,它们具有不同的范围并且还包含负值,而Image- J输出都是正数,范围是0-1。在与scikit-image兼容之前,我是否必须以某种方式重新调整我的Image-J值?

或许更简单的问题。如何仅使用scikit-image

从头开始创建用于颜色反卷积的染色矩阵

谢谢, 马里奥

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