PyTorch的数据加载器"太多的打开文件"没有文件应该打开时出错

时间:2018-01-14 13:27:22

标签: python python-3.x pytorch

所以这是一个说明问题的最小代码:

这是数据集:

class IceShipDataset(Dataset):
    BAND1='band_1'
    BAND2='band_2'
    IMAGE='image'

    @staticmethod
    def get_band_img(sample,band):
        pic_size=75
        img=np.array(sample[band])
        img.resize(pic_size,pic_size)
        return img

    def __init__(self,data,transform=None):
        self.data=data
        self.transform=transform

    def __len__(self):
        return len(self.data)  

    def __getitem__(self, idx):

        sample=self.data[idx]
        band1_img=IceShipDataset.get_band_img(sample,self.BAND1)
        band2_img=IceShipDataset.get_band_img(sample,self.BAND2)
        img=np.stack([band1_img,band2_img],2)
        sample[self.IMAGE]=img
        if self.transform is not None:
                sample=self.transform(sample)
        return sample

这是失败的代码:

PLAY_BATCH_SIZE=4
#load data. There are 1604 examples.
with open('train.json','r') as f:
        data=f.read()
data=json.loads(data)

ds=IceShipDataset(data)
playloader = torch.utils.data.DataLoader(ds, batch_size=PLAY_BATCH_SIZE,
                                          shuffle=False, num_workers=4)
for i,data in enumerate(playloader):
        print(i)

它在for循环中给出了奇怪的打开文件错误... 我的火炬版本是0.3.0.post4

如果你想要json文件,它可以在Kaggle(https://www.kaggle.com/c/statoil-iceberg-classifier-challenge

中找到

我应该提一下,这个错误与我的笔记本电脑的状态无关:

yoni@yoni-Lenovo-Z710:~$ lsof | wc -l
89114
yoni@yoni-Lenovo-Z710:~$ cat /proc/sys/fs/file-max
791958

我在这里做错了什么?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我知道如何解决错误,但我没有完整解释原因。

首先,解决方案:您需要确保将图像数据存储为numpy.array,当您调用json.loads时,它会将它们加载为python {{1 list的s。这会导致float将列表中的每个浮点数单独转换为torch.utils.data.DataLoader

查看torch.DoubleTensor中的default_collate - 您的torch.utils.data.DataLoader会返回__getitem__这是一个映射,因此dict会在每个元素上再次调用default_collate dict。第一对是int s,但是你得到的图像数据是list,即collections.Sequence - 这就是因为调用了default_collate而变得时髦的地方在列表的每个元素上。这显然不是你想要的。我不知道torch中关于listnumpy.array的内容的假设是什么,但如果出现错误,则表明该假设正在被违反。< / p>

修复非常简单,只需确保两个图像带为numpy.array,例如__init__

def __init__(self,data,transform=None):
    self.data=[]
    for d in data:
        d[self.BAND1] = np.asarray(d[self.BAND1])
        d[self.BAND2] = np.asarray(d[self.BAND2])
        self.data.append(d)
    self.transform=transform

或者在加载json之后,只要你这样做,那么你做什么并不重要。

为什么上述结果会导致too many open files

我不知道,但正如评论所指出的那样,它可能与进程间通信和两个队列上的锁定文件有关,数据是从中获取并添加的。

脚注:由于比赛仍在开放,因此无法从Kaggle下载train.json(??)。我制作了一个虚拟的json文件,该文件应具有相同的结构并测试该虚拟文件上的修复。