我试图从使用{factoextra}包中的函数fviz_dist生成的ggplot中获取矩阵(Ordered dissimilarity matrix)。
根据我的原始数据,我使用dis.cor(我需要使用spearman相关系数)生成距离相关矩阵,如下所示:
dist.cor< -get_dist(b,method =" spearman")
℃下-round(as.matrix(dist.cor)[1:nrow(b)中,1:nrow(B)],1)
但是这个矩阵没有排序,因此您无法将群集可视化。
然后,使用函数fviz_dist,我可以生成距离相关矩阵的ggplot(已订购):
fviz_dist(dist.cor)
但是我不需要图像,我需要数据帧或矩阵格式的有序矩阵,因此我可以使用write.csv将其导出并在excel中打开它以使用它。
谢谢!