我已经多次检查 fastqc 安装在bin文件夹和
中library("fastqcr")
也没有给出任何错误我仍然收到以下命令的 sh:1:fastqc:not found 错误
fastqc(fq.dir = "~/WES_Pipeline/Data", # FASTQ files directory
qc.dir = "~/WES_Pipeline/FASTQC", # Results direcory
threads = 4 # Number of threads
)
我无法弄清楚这个错误的可能原因是什么。
我目前在ubuntu 14.04中使用R-version 3.4.3,Bioconductor 3.6。