我想用python中的医学图像分割肝脏。我的方法是将图像组织到文件夹中（每个患者ID一个文件夹）并将每个2D图像与其相应的掩码组合。生成的图像应该写成相同的文件夹。
我已经生成了面具。添加两个图像并不会产生预期的结果，但它应该是某种“逆减法”。但我不知道如何实现这一点。
我也不知道如何自动化这个过程，所以我不必总是指定文件夹 - 我希望程序能够自动在文件夹之间切换。
例如打字 image1 = imread（＆＃34; / Downloads / image1＆＃34;）; image1_mask = imread（＆＃34; / Downloads / image1_mask＆＃34;）; result = image1 + image1_mask
要求我指定每个图像组合的路径。是否有一个良好的命名策略，以使过程更容易？我尝试用for循环实现它，但它不起作用。
正如我所说，添加也不会产生预期的结果（图像减法也没有）
提前谢谢！ 玛利亚
答案 0 :(得分：1)
你问了几个问题。
如果你只想显示这些像素，那么掩码的相应像素是非零的，那么你需要多重，而不是添加。 E.g。
import numpy as np
image = np.random.randint(1,255,(5,5))
mask = np.zeros((5,5))
mask[1:,2:4]=10
newImage = image * (mask!=0)
print(image, mask, newImage,sep='\n')
自动传递目录是一个完全不同的问题，SO上有很多类似的问题。