如果其中一个输入文件比其中一个输出文件新，或者其中一个输入文件将被另一个作业更新，则Snakemake仅重新运行作业

Question

我是蛇皮新手。当我阅读蛇形码头中的Snakemake教程the last sentence in step one时，我无法理解其含义。有人可以解释一下，非常感谢！

  

如果其中一个输入文件比其中一个输出文件新，或者其中一个输入文件将被另一个作业更新，则Snakemake仅重新运行作业。

Answer 1

这意味着当您运行Snakemake时，它将查找工作流中定义的结果文件（此处为mapped_reads/A.bam）。如果文件已经存在，Snakemake将不会运行工作流程。但它也会检查所涉及文件的时间戳。如果更改输入文件，它也可能会更改输出。因此，如果Snakemake发现输入比输出更新，它将重新运行工作流程。