计算多个重叠多边形(shapefile)中的栅格横向比例(百分比)?

时间:2018-01-02 14:49:17

标签: statistics classification polygon raster qgis

我认为最简单的方法是提取每个多边形内的栅格值并计算比例。是否可以在不将整个网格作为数组读取的情况下这样做?

我从1992年到2015年有23个年度全球分类栅格(分辨率= 0.00277778度)和354个形状的多边形矢量(在某些部分重叠)。由于重叠(自相交),使用它们作为光栅并不容易。两者都投射在" + proj = longlat + datum = WGS84 + no_defs"。

栅格由10 - 220的类组成 多边形的ABC_ID为1 - 449

一年看起来像: classification and shape example

我需要创建一个像:

这样的表

example table

我已经尝试用以下方法实现这一目标:

  1. 区域统计
  2. Pk工具(从栅格中提取矢量样本)
  3. LecoS(叠加栅格指标)
  4. 交叉分类和制表" SAGA GIS(范围问题)
  5. FRAGSTATS(我无法加载shp文件)
  6. 光栅 - >提取 - > Clipper剂量不起作用(Ring Self-intersection)
  7. 我听说ArcMap中的Tabulate Area可以做到这一点,但如果有一个开源解决方案就可以了。

2 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我已经成功地使用Python“rasterio”和“geopandas”

它现在创建一个表格,如: example result

因为我没有找到像R“raster”中的提取物命令类似的东西,所以它只花了不到2行,而不是计算一半的夜晚,现在一年只需要2分钟。 结果是一样的。它基于“https://gis.stackexchange.com/questions/260304/extract-raster-values-within-shapefile-with-pygeoprocessing-or-gdal/260380

中“基因”的思想
import rasterio
from rasterio.mask import mask
import geopandas as gpd
import pandas as pd

print('1. Read shapefile')

shape_fn = "D:/path/path/multypoly.shp"
raster_fn = "D:/path/path/class_1992.tif"

# set max and min class
raster_min = 10
raster_max = 230

output_dir = 'C:/Temp/'

write_zero_frequencies = True
show_plot = False

shapefile = gpd.read_file(shape_fn)

# extract the geometries in GeoJSON format
geoms = shapefile.geometry.values # list of shapely geometries
records = shapefile.values

with rasterio.open(raster_fn) as src:

     print('nodata value:', src.nodata)

     idx_area = 0
     # for upslope_area in geoms:
     for index, row in shapefile.iterrows():

          upslope_area = row['geometry']
          lake_id = row['ABC_ID']
          print('\n', idx_area, lake_id, '\n')

          # transform to GeJSON format
          from shapely.geometry import mapping
          mapped_geom = [mapping(upslope_area)]

          print('2. Cropping raster values')
          # extract the raster values values within the polygon
          out_image, out_transform = mask(src, mapped_geom, crop=True)

          # no data values of the original raster
          no_data=src.nodata

          # extract the values of the masked array
          data = out_image.data[0]

          # extract the row, columns of the valid values
          import numpy as np
          # row, col = np.where(data != no_data)
          clas = np.extract(data != no_data, data)

          # from rasterio import Affine # or from affine import Affine
          # T1 = out_transform * Affine.translation(0.5, 0.5) # reference the pixel centre
          # rc2xy = lambda r, c: (c, r) * T1

          # d = gpd.GeoDataFrame({'col':col,'row':row,'clas':clas})

          range_min = raster_min    # min(clas)
          range_max = raster_max    # max(clas)

          classes = range(range_min, range_max + 2)

          frequencies, class_limits = np.histogram(clas,
                                                   bins=classes,
                                                   range=[range_min, range_max])

          if idx_area == 0:
               # data_frame = gpd.GeoDataFrame({'freq_' + str(lake_id):frequencies})
               data_frame = pd.DataFrame({'freq_' + str(lake_id): frequencies})
               data_frame.index = class_limits[:-1]
          else:
               data_frame['freq_' + str(lake_id)] = frequencies
      idx_area += 1

 print(data_frame)
 data_frame.to_csv(output_dir + 'upslope_area_1992.csv', sep='\t')

答案 1 :(得分:0)

我可以使用R命令提取并使用表格对其进行汇总,如#34; Spacedman"见:https://gis.stackexchange.com/questions/23614/get-raster-values-from-a-polygon-overlay-in-opensource-gis-solutions

shapes <- readOGR("C://data/.../shape)
LClass_1992 <- raster("C://.../LClass_1992.tif")
value_list <- extract (LClass, shapes )

stats  <- lapply(value_list,table)
[[354]]

10   11   30   40   60   70   80   90  100  110  130  150  180  190  200  201  210
67  303  233  450 1021 8241   65 6461 2823   88 6396    5   35  125   80   70 1027

但这需要很长时间(半夜)。 我会尝试用Python做它可能会更快。 也许有人做过类似的事情,可以分享代码。

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