为什么流式查询失败" InvalidSchemaException:组类型不能为空(...)空组:spark_schema"写到实木复合地板?

时间:2017-12-30 14:25:38

标签: apache-spark parquet spark-structured-streaming

我将Spark 2.2.1与Parquet 1.8.1一起使用。

我想从Kafka读取JSON数据并进行一些转换,然后将数据写入镶木地板文件,然后由Apache Hive加载。但是当writeStream到镶木地板时我遇到了以下错误。

Caused by: org.apache.parquet.schema.InvalidSchemaException: A group type can not be empty. Parquet does not support empty group without leaves. Empty group: spark_schema
    at org.apache.parquet.schema.GroupType.<init>(GroupType.java:92)
    at org.apache.parquet.schema.GroupType.<init>(GroupType.java:48)
    at org.apache.parquet.schema.MessageType.<init>(MessageType.java:50)
    at org.apache.parquet.schema.Types$MessageTypeBuilder.named(Types.java:1256)
    at org.apache.spark.sql.execution.datasources.parquet.ParquetSchemaConverter$.<init>(ParquetSchemaConverter.scala:563)
    at org.apache.spark.sql.execution.datasources.parquet.ParquetSchemaConverter$.<clinit>(ParquetSchemaConverter.scala)
    ... 22 more

我用谷歌搜索并发现其他人遇到的issue相同,其根本原因并非所有字段都是实木拼花不支持的叶子,但在我的数据框中有所有叶子字段。为什么?提前谢谢!

这是我的代码:

  val nestTimestampFormat = "yyyy-MM-dd'T'HH:mm:ss.sss'Z'"
  val jsonOptions: Map[String, String] = Map{ "timestampFormat" -> nestTimestampFormat }
  val df = spark
    .readStream
    .format("kafka")
    .option("kafka.bootstrap.servers", "localhost:9092")
    .option("subscribe", "wikipedia-edits")
    .option("startingOffsets", "earliest")
    .option("group.id", "SparkProcessor")
    .load()
    .select(from_json(col("value").cast("string"), schema, jsonOptions) as "wikiEdit")

  val parsed = df.select("wikiEdit.bot", "wikiEdit.title", "wikiEdit.user", "wikiEdit.wiki")

  parsed.printSchema()

  //parsed.writeStream.format("console").option("truncate", false).start().awaitTermination(30000)

  parsed.writeStream.format("parquet")
    .option("path","hdfs://localhost:9000/wiki-parquet-spark")
    .option("checkpointLocation", "hdfs://localhost:9000/checkpoint")
    .trigger(Trigger.ProcessingTime(10*1000))
    .start.awaitTermination()

程序可以打印模式并在数据框中显示一些数据。

root
 |-- bot: boolean (nullable = true)
 |-- title: string (nullable = true)
 |-- user: string (nullable = true)
 |-- wiki: string (nullable = true)

-------------------------------------------
Batch: 0
-------------------------------------------
+-----+-----------------------------+----------+-----------+
|bot  |title                        |user      |wiki       |
+-----+-----------------------------+----------+-----------+
|false|Jak Roberto                  |WikiPedant|enwiki     |
|false|File:Oostkamp01.jpg          |Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:CC-BY-SA-4.0        |Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:Self-published work |Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:Geography of Belgium|Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:CC-BY-SA-4.0        |Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:Self-published work |Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:Geography of Belgium|Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:CC-BY-SA-4.0        |Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:Self-published work |Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:Geography of Belgium|Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:CC-BY-SA-4.0        |Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:Self-published work |Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:Geography of Belgium|Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:CC-BY-SA-4.0        |Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:Self-published work |Herpoel   |commonswiki|
|false|Category:Geography of Belgium|Herpoel   |commonswiki|
|true |Category:CC-BY-SA-4.0        |Herpoel   |commonswiki|
|true |Category:Self-published work |Herpoel   |commonswiki|
|true |Category:Geography of Belgium|Herpoel   |commonswiki|
+-----+-----------------------------+----------+-----------+
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1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

TL; DR 升级到Spark 2.2.0(甚至更好到2.2.1)。

认为它与PARQUET-363 Cannot construct empty MessageType for ReadContext.requestedSchema有关,确实提到了错误消息和Spark。

  

在parquet-mr 1.8.1中,不再允许构造空的GroupType(以及MessageType)(参见PARQUET-278)。这种变化在大多数情况下都有意义,因为Parquet不支持空组。但是,有一个用例,其中空MessageType有效,即在计算Parquet文件中的行时将空MessageType作为ReadContext的requestedSchema构造函数参数传递。它的工作原理是,Parquet可以从块元数据中检索行数,而不会实现任何列。

稍后在问题报告中:

  

我们可以看到Spark SQL没有将请求的列传递给底层的Parquet阅读器。

该问题报告与pull request #263相关联:

  

这将删除PARQUET-278中添加的拒绝架构组的检查   没有领域。允许并使用从文件中选择0列   由Hive和SparkSQL实现查询,如select count(1)...

并且拉取请求会删除检查(您在流式数据集/ Spark结构化流式传输中遇到过的)。

throw new InvalidSchemaException("A group type can not be empty. Parquet does not support empty group without leaves. Empty group: " + name);

据此,我们了解到Spark 中的Parquet版本可能与1.8版本分支不同。

这导致pull request中的讨论最终因为另一个pull request被关闭而被接受为被接受为 1.8.2 的镶嵌版本的一部分。这就是我们希望摆脱错误信息的Parquet版本。

由于Spark从Spark 2.2.0开始使用Parquet 1.8.2,我建议升级到Spark 2.2.0(甚至更好到2.2.1)。