用R表示含有1和0的矩阵的热图

Question

下面是我的示例数据，基本上是一个行名称为人名的矩阵 以及每个行的一些列。我在数据中只有零和一个。我想用热图来形象化它。 （红色表示0秒，绿色表示1秒或任何其他颜色编码）。我如何使用R实现此目的？你可以使用任何只有1和0（二进制值）的示例数据集向我展示。

Answer 1

使用ggplot

的另一种方法

library(ggplot2)
library(reshape2)
library(plyr)
library(scales)

df <- structure(list(people = structure(c(2L, 1L), .Label = c("Dwayne", "LeBron"), class = "factor"),
                 G = c(1L, 0L),
                 MIN = c(1L, 0L),
                 PTS = c(0L, 1L),
                 FGM = c(0L,0L),
                 FGA = c(0L,0L),
                 FGP = c(1L,1L)),
            .Names = c("people", "G", "MIN", "PTS", "FGM", "FGA", "FGP"),
            class = "data.frame",
            row.names = c(NA, -2L))


df.m <- melt(df)
df1.m <- ddply(df.m, .(variable), transform, rescale = value)
p <- ggplot(df1.m, aes(variable, people)) +
geom_tile(aes(fill = rescale), colour = "black")
p + scale_fill_gradient(low = "green", high = "red")
show(p)

通过此tutorial

Answer 2

使用highcharter:

library(highcharter)
library(tidyr)
library(dplyr)
df<-data.frame(row=c("Dwayne","James"),G=c(1,0),MIN=c(1,0),PTS=c(0,1),FGM=c(0,0),FGA=c(0,0),FGP=c(1,1))
rownames(df)<-c("Dwayne","James")
df$row<-rownames(df)
data<-df%>%
     tidyr::gather(row,value)%>%
     setNames(c("name","variable","value"))


hchart(data, "heatmap", hcaes(x = variable, y = name, value = value)) %>% 
  hc_colorAxis(stops = color_stops(2, c("red","green")))

的更新： 您可以为身高= 800添加hc_size(height = 800)或制作类似

的内容

  x<-50
  hg<-length(unique(data$name))*x+100

  hchart(data, "heatmap", hcaes(x = variable, y = name, value = value)) %>% 
    hc_colorAxis(stops = color_stops(2, c("red","green")))%>% 
    hc_size(height = hg)

数据集中的每一行使图表大50点。您可以在x

中进行更改

Answer 3

此答案使用plotly，因此将其添加为另一个答案。使用与以下数据相同的数据。

library(plotly)
df1 <- as.matrix(df)
p <- plot_ly(x = colnames(df), y = df[,1], z = as.matrix(df[-1]), colors = colorRamp(c("green", "red")), type = "heatmap")

在获取输出方面，这比ggplot2简单得多。

希望这有帮助！