Question

我知道这个bash代码用于对一个目录中的所有文件执行操作：

for files in dir/*.ext; do 
cmd option "${files%.*}.ext" out "${files%.*}.newext"; done

但是现在我必须对一个目录中的所有文件执行操作，所有文件都在另一个目录中，文件名相同但扩展名不同。例如

directory 1 -> file1.txt, file2.txt, file3.txt
directory 2 -> file1.csv, file2.csv, file3.csv

cmd file1.txt file1.csv > file1.newext
cmd file2.txt file2.csv > file2.newext

我不能比较两个文件，但我必须执行的脚本需要两个文件来生成另一个文件（特别是我必须执行 bwa samsa path_to_ref/ref file1.txt file1.csv > file1.newext）

你能帮帮我吗？

感谢您的回答！

Answer 1

使用变量操作的bash：

$ for f in test/* ; do t="${f##*/}";  echo "$f" test2/"${t%.txt}".csv ; done
test/file1.txt test2/file1.csv
test/file2.txt test2/file2.csv
test/file3.txt test2/file3.csv

修改

实施@DavidC.Rankin的保险建议：

$ touch test/futile for f in test/* do t="${f##*/}" t="test2/${t%.txt}".csv if [ -e "$t" ] then echo "$f" "$t" fi done test/file1.txt test2/file1.csv test/file2.txt test2/file2.csv test/file3.txt test2/file3.csv

Answer 2

尝试：

for file in path_to_txt/*.txt; do 
   b=$(basename $file .txt)
   cmd path_to_txt/$b.txt path_to_csv/$b.csv 
done

如果此命令不需要，则不包括调用“cmd”的路径。
“for”语句如果在.txt文件目录中运行，则不能包含路径
如果执行时间是必需的，则可以用posix regexp替换basename。见https://stackoverflow.com/a/2664746/4886927

Bash如何在两个目录中执行文件命令

2 个答案: