Question

我有一个＆＃34; Master R脚本＆＃34;使用＆＃34; source（）＆＃34;运行多个R脚本。它看起来像这样：

source("script1.R")
source("script2.R")
source("script3.R")
source("script4.R")
source("script5.R")
source("script6.R")
source("script7.R")
source("script8.R")

脚本1到8需要按顺序运行。这个＆＃34; Master R脚本＆＃34;计划使用cron和＆＃34; Rscript＆＃34;命令。

Rscript --verbose --vanilla "master_r_script.R"

我的＆＃34; Master R脚本＆＃34;抛出＆＃34;错误=＆＃39;无法分配内存＆＃39;＆＃34;运行几个R脚本后。我试过调用＆＃34; rm（list = ls（））＆＃34;和＆＃34; gc（verbose = TRUE，reset = TRUE）＆＃34;在每一个＆＃34;来源（）＆＃34;命令，但仍然没有解决问题。

我需要一种以某种方式＆＃34;清理＆＃34; R环境并释放内存。我当然可以分解＆＃34; Master R脚本＆＃34;进入多个＆＃34; RScript调用＆＃34;但我想避免这样做。

我怎样才能重新开始＆＃34;由＆＃34; Rscript＆＃34;创建的会话。解决方案here不适用，因为他们正在重新启动R REPL会话。

Answer 1

简短答案：

您无法成功清除环境的主要原因是因为您（在R文件中）没有保存rm命令的结果。

扩展答案：

如果在Rscript [rm（list = ls（））]和[gc（verbose = TRUE，reset = TRUE）]中使用以下命令，则需要在每个脚本中添加[load（'。RData'）]和[save.image（'。RData'）。

由于Rscript和R终端并不动态地充当与Rstudio相反的角色，因此每次Rscript不在运行状态时，它都不会记住环境的状态，但是运行Rscript当然会加载[.RData]将充当全球环境。

在[主脚本]中，您应该首先使用上述命令清理环境，或者使用单独的脚本作为源文件并包含“清理”。

使用RScript重新启动环境

1 个答案: