Question

我有一个StringList的ArrayList

的System.out.println（Al.get（1））

AX225025 Equine influenza virus H3N8 // 8 (NS)
CAAAAGCAGGGTGACAAAAACATGATGGATTCCAACACTGTGTCAAGCTTTCAGGTAGACTGTTTTCTTT
GGCATGTCCGCAAACGATTTGCAGACCAAGAACTGGGTGATGCCCCATTCCTTGACCGGCTTCGCCGAGA

的System.out.println（Al.get（2））

>LC335987 A/mute swan/Shimane/3211A001/2017 2017/11/05 8 (NS)
CCAGAAGTCCCTAAAAGGAAGAGGTAGCACTCTTGGTCTGGACATCGAAACAGCCACTCGTGCAGGAAAG
CAGATAGTGGAGCAGATTCTGGAAGAGGAATCAGATGAGGCACTTAAAATGACCATTGCCTCTGTTCCTG

有没有办法跳过标题行，这样我就可以对序列进行分析，而不会完全将序列与序列分开？

Answer 1

您只需要在第一个换行符之后开始的输入子字符串。这很简单：

private static String trimHeader(String input) {
    return input.substring(input.indexOf('\n') + 1);
}

Answer 2

假设标题和序列行中有模式，您可以按(NS)拆分/标记字符串

这将为您提供项目序列

String sequence = AI.get(1).split("(NS)")[1]

对于包含长元素的ArrayList <string>，如何跳过第一行？

2 个答案: