错误：评估嵌套太深：无限递归/选项（表达式=）？ rhierbaps

Question

我试图在一组729个菌株中运行R中的rhierbaps，这是我正在使用的代码（与用于该程序的示例中的代码完全相同）：

#load data
fasta.rhierBAPS_Ef <- system.file("extdata", "Concatenated.fas", package = "rhierbaps")

#SNP Matrix
snp.matrix <- load_fasta(fasta.rhierBAPS_Ef)

#rhierBAPS
hb.results <- hierBAPS(snp.matrix, max.depth = 2, n.pops = 10, n.extra.rounds = Inf, 
                       quiet = TRUE)

当我这样做时，得到错误：

Error: evaluation nested too deeply: infinite recursion / options(expressions=)?
Error during wrapup:

然后Rstudio阻止并中止......

你能帮我解决这个问题吗？

Answer 1

您错误地指定了：n.pops = 0 使用正整数作为上限，它将起作用。