我是一台拥有128 GB RAM的64位PC,而且我使用的是C#和.NET 4.5。 我有以下代码:
double[,] m1 = new double[65535, 65535];
long l1 = m1.LongLength;
double[,] m2 = new double[65536, 65536]; // Array dimensions exceeded supported range
long l2 = m2.LongLength;
我知道<gcAllowVeryLargeObjects enabled="true" />
并且我已将其设置为true。
为什么多维数组的元素数不能超过4294967295? 我看到了以下答案https://stackoverflow.com/a/2338797/7556646。
我还检查了gcAllowVeryLargeObjects的文档,我看到了以下注释。
数组中的最大元素数为UInt32.MaxValue(4294967295)。
我无法理解为什么会有这个限制?有解决方法吗?是否计划在即将推出的.net版本中删除此限制?
我需要在内存中为什么这样的元素,因为我想计算一个使用英特尔MKL的对称特征值分解。
[DllImport("custom_mkl", CallingConvention = CallingConvention.Cdecl, ExactSpelling = true, SetLastError = false)]
internal static extern lapack_int LAPACKE_dsyevd(
int matrix_layout, char jobz, char uplo, lapack_int n, [In, Out] double[,] a, lapack_int lda, [In, Out] double[] w);
答案 0 :(得分:2)
免责声明:此版本比预期更长
CLR不支持托管堆上的大型数组有多种原因。
其中一些是技术性的,其中一些可能是“范式”。
这个blog post涉及到为什么存在限制的一些原因。基本上,由于内存碎片,决定限制(大写O)对象的最大大小。实现处理较大对象的成本与这样一个事实进行权衡,即在大多数情况下,由于程序员的设计谬误,需要这样大的对象和那些需要大量对象的用例。 因为,对于CLR,所有都是一个对象,这个限制也适用于数组。为了强制实施此限制,数组索引器采用有符号整数设计。
但是一旦你确定,你的程序设计要求你有这么大的阵列,你将需要一个解决方法。
上面提到的博客文章还表明,您可以在不进入非托管区域的情况下实现大型数组。
但正如Evk在评论中指出的那样,你想通过PInvoke将数组作为一个整体传递给外部函数。这意味着您将需要非托管堆上的数组,或者它必须在调用期间进行封送处理。并且对整个事情进行编组是一个坏主意,这个数组很大。
因此,由于托管堆不可能,您需要在非托管堆上分配空间并将该空间用于您的阵列。
假设你需要8 GB的空间:
long size = (1L << 33);
IntPtr basePointer = System.Runtime.InteropServices.Marshal.AllocHGlobal((IntPtr)size);
大!现在,您在虚拟内存中有一个区域,您可以在其中存储最多8 GB的数据。
如何将其转换为数组?
C#中有两种方法
这将让你使用指针。指针可以转换为数组。 (在香草C中,它们通常是同一个)
如果您对如何通过指针实现2D阵列有一个好主意,那么这将是您的最佳选择。
这是pointer
您不需要不安全的上下文,而是必须将您的数据从托管堆“编组”到非托管堆。你仍然需要理解指针算法。
您要使用的两个主要功能是PtrToStructure和反向StructureToPtr。使用其中一个,您将从非托管堆上的指定位置获取值类型(例如double)的副本。使用另一个,您将在非托管堆上放置值类型的副本。
从某种意义上说,这两种方法都是“不安全的”。您需要知道自己的pointers
您可能希望将2D阵列设计转换为一维阵列设计
在任何情况下,您都希望将其全部包装到具有相应检查和destsructors的类中。
以下是基于非托管堆的“类似”数组的泛型类。
特色包括:
T
可以成为值类型的类型。如果您注意到,我不会进行任何类型检查,因此如果Marshal.SizeOf
无法返回正确的数字,我们会落入上述其中一个坑中。
您必须自己实施的功能包括:
p = x * size + y
所以,只使用它作为灵感,如果有的话。
using static System.Runtime.InteropServices.Marshal;
public class LongArray<T> : IDisposable where T : struct {
private IntPtr _head;
private Int64 _capacity;
private UInt64 _bytes;
private Int32 _elementSize;
public LongArray(long capacity) {
if(_capacity < 0) throw new ArgumentException("The capacity can not be negative");
_elementSize = SizeOf(default(T));
_capacity = capacity;
_bytes = (ulong)capacity * (ulong)_elementSize;
_head = AllocHGlobal((IntPtr)_bytes);
}
public T this[long index] {
get {
IntPtr p = _getAddress(index);
T val = (T)System.Runtime.InteropServices.Marshal.PtrToStructure(p, typeof(T));
return val;
}
set {
IntPtr p = _getAddress(index);
StructureToPtr<T>(value, p, true);
}
}
protected bool disposed = false;
public void Dispose() {
if(!disposed) {
FreeHGlobal((IntPtr)_head);
disposed = true;
}
}
protected IntPtr _getAddress(long index) {
if(disposed) throw new ObjectDisposedException("Can't access the array once it has been disposed!");
if(index < 0) throw new IndexOutOfRangeException("Negative indices are not allowed");
if(!(index < _capacity)) throw new IndexOutOfRangeException("Index is out of bounds of this array");
return (IntPtr)((ulong)_head + (ulong)index * (ulong)(_elementSize));
}
}
答案 1 :(得分:0)
我已经使用了answer中的MrPaulch中的“元帅”方法的基本示例,以创建名为HugeMatrix<T>
的以下类:
public class HugeMatrix<T> : IDisposable
where T : struct
{
public IntPtr Pointer
{
get { return pointer; }
}
private IntPtr pointer = IntPtr.Zero;
public int NRows
{
get { return Transposed ? _NColumns : _NRows; }
}
private int _NRows = 0;
public int NColumns
{
get { return Transposed ? _NRows : _NColumns; }
}
private int _NColumns = 0;
public bool Transposed
{
get { return _Transposed; }
set { _Transposed = value; }
}
private bool _Transposed = false;
private ulong b_element_size = 0;
private ulong b_row_size = 0;
private ulong b_size = 0;
private bool disposed = false;
public HugeMatrix()
: this(0, 0)
{
}
public HugeMatrix(int nrows, int ncols, bool transposed = false)
{
if (nrows < 0)
throw new ArgumentException("The number of rows can not be negative");
if (ncols < 0)
throw new ArgumentException("The number of columns can not be negative");
_NRows = transposed ? ncols : nrows;
_NColumns = transposed ? nrows : ncols;
_Transposed = transposed;
b_element_size = (ulong)(Marshal.SizeOf(typeof(T)));
b_row_size = (ulong)_NColumns * b_element_size;
b_size = (ulong)_NRows * b_row_size;
pointer = Marshal.AllocHGlobal((IntPtr)b_size);
disposed = false;
}
public HugeMatrix(T[,] matrix, bool transposed = false)
: this(matrix.GetLength(0), matrix.GetLength(1), transposed)
{
int nrows = matrix.GetLength(0);
int ncols = matrix.GetLength(1);
for (int i1 = 0; i1 < nrows; i1++)
for (int i2 = 0; i2 < ncols; i2++)
this[i1, i2] = matrix[i1, i2];
}
public void Dispose()
{
if (!disposed)
{
Marshal.FreeHGlobal(pointer);
_NRows = 0;
_NColumns = 0;
_Transposed = false;
b_element_size = 0;
b_row_size = 0;
b_size = 0;
pointer = IntPtr.Zero;
disposed = true;
}
}
public void Transpose()
{
_Transposed = !_Transposed;
}
public T this[int i_row, int i_col]
{
get
{
IntPtr p = getAddress(i_row, i_col);
return (T)Marshal.PtrToStructure(p, typeof(T));
}
set
{
IntPtr p = getAddress(i_row, i_col);
Marshal.StructureToPtr(value, p, true);
}
}
private IntPtr getAddress(int i_row, int i_col)
{
if (disposed)
throw new ObjectDisposedException("Can't access the matrix once it has been disposed");
if (i_row < 0)
throw new IndexOutOfRangeException("Negative row indices are not allowed");
if (i_row >= NRows)
throw new IndexOutOfRangeException("Row index is out of bounds of this matrix");
if (i_col < 0)
throw new IndexOutOfRangeException("Negative column indices are not allowed");
if (i_col >= NColumns)
throw new IndexOutOfRangeException("Column index is out of bounds of this matrix");
int i1 = Transposed ? i_col : i_row;
int i2 = Transposed ? i_row : i_col;
ulong p_row = (ulong)pointer + b_row_size * (ulong)i1;
IntPtr p = (IntPtr)(p_row + b_element_size * (ulong)i2);
return p;
}
}
现在我可以调用具有巨大矩阵的英特尔MKL库,例如:
[DllImport("custom_mkl", CallingConvention = CallingConvention.Cdecl, ExactSpelling = true, SetLastError = false)]
internal static extern lapack_int LAPACKE_dsyevd(
int matrix_layout, char jobz, char uplo, lapack_int n, [In, Out] IntPtr a, lapack_int lda, [In, Out] double[] w);
对于参数IntPtr a
,我传递了Pointer
类的HugeMatrix<T>
属性。