由于权限丢失，git cherry pick失败

Question

我有一个存储库，其中包含root所拥有的一些文件和目录，而不是Linux（Debian）上的普通用户。 当这些文件在提交之间（在相同或不同的分支上）更改并且我在这些提交之间签出时，由于权限而失败。

error: unable to unlink old 'fileownedbyroot' (Permission denied)

这通常不是问题，因为我只需要在这些文件的父目录上chmod o + w -R然后git checkout - 正确完成结帐。 在此之后，我将权限更改回原始值（chmod o -w -R）。这很好。

然而，当我做一个樱桃挑选时，我有同样的问题，但不同的是没有消息说樱桃选择失败了。

git status给出：

    Changes not staged for commit:
    (use "git add <file>..." to update what will be committed)
    (use "git checkout -- <file>..." to discard changes in working directory)

    modified:   file1
    modified:   file2
    .. and so on`

对于所有不拥有的文件，root用户不再拥有这些文件的状态。此外，没有任何迹象表明我仍在采摘（因为冲突时失败）。

我有什么解决方案？手动修改root拥有的文件并应用提交？在这种情况下再次应用樱桃酱？我只想确保我的回购保持清洁。

我的本​​地git版本是2.1.4

由于