我正在尝试使用R中的biparite包来可视化双极网络。我的数据由电子表格中的4列组成。列包含1）植物种类名称
2）蜂种名称
3）位点
4）相互作用频率。
我首先从CSV文件中将数据读入R，然后使用辅助函数frame2webs将其转换为Web。当我尝试使用plotweb()可视化网络时，我收到错误消息：
网页错误[rind，cind，drop = FALSE]：维数不正确
我的代码如下所示：
library(bipartite)
bee <- read.csv('TestFile.csv')
bees <- as.data.frame(bee)
BeeWeb <- frame2webs(bees, type.out = "array")
plotweb(BeeWeb)
我也试过了：
BeeWeb <- frame2webs(bees,
varnames = c("higher","lower","webID","freq"),
type.out = "array")
请帮忙！我是R的新手，正在努力做到这一点。干杯！
答案 0 :(得分：0)
不确定您的数据是什么样子，但是当我在“较高”或“较低”列中只有一个因子水平，type.out为“列表”且emptylist为TRUE时，这会发生在我身上。
这是由于存在一个空问题，frame2webs仅在type.out为“ list”且emptylist为TRUE时才调用该函数。 empty使用NROW和NCOL查找数据的维，它们将单行输入解释为垂直向量。当“较低”或“较高”中只有一个因子水平时，为空的输入是一个单行数组。 empty将此行解释为一列，因此出现“尺寸错误”错误。
两个简单的解决方法：