Question

这是关注我之前的帖子：How to measure the area of a polygon in ggplot2?

我现在要做的是将结果雷达图表用作完全独立的散点图中的数据点，或者保存对象并稍后在图形上使用它来描绘实际数据的形状。

我有很多文件，它们通常看起来像这样。它们的编号范围从1到多，并且分数始终为降序格式。即＃1在任何给定文件中总是贡献最多。

myfile
01 0.31707317
02 0.12195122
03 0.09756098
04 0.07317073
05 0.07317073
06 0.07317073
07 0.07317073
08 0.07317073
09 0.04878049
10 0.04878049

在这里，我想为每个文件单独绘制一个雷达图，只是得到没有网格的形状。 ggradar是我找到的最接近和最好的。

ggradar(as.matrix(t(radar)), group.point.size = 2, grid.line.width = 0, grid.max = 1.0, grid.mid = 0, 
    grid.min = 0, axis.line.colour = "white", axis.label.size = 0, grid.label.size = 0, 
    centre.y = 0, background.circle.colour = "white", group.colours = "black", group.line.width = 1)

现在，当我想将这些形状用作数据点时问题就开始了。

@brian善意地评论并暗示如何处理这个问题。

R::ggplot2::geom_points: how to swap points with pie charts?

Small ggplot2 plots placed on coordinates on a ggmap

受这些评论的启发，我现在可以将图表与文件名一起保存为一列，并使用相同的管道继续添加新文件。

  for (file in file_list){
#eliminate the empty files (they contain only the header)
if (file.size(file) > 420){
  # if the merged dataset does exist, append to it
  if (exists("dfradar")){
    radarfile <-read.table(file, header=TRUE, sep="\t")
    radarfile1 <- as.data.frame(as.numeric(radarfile[,3]))
    rownames(radarfile1) <- c(1:nrow(radarfile))
    dfradar1 <- ggradar(t(radarfile1), group.point.size = 1, grid.line.width = 0, grid.max = 1, grid.mid = 0, 
                        grid.min = 0, axis.line.colour = "white", axis.label.size = 0, grid.label.size = 0, 
                        centre.y = 0, background.circle.colour = "white", group.colours = "black", group.line.width = 0.5) + 
                    theme(legend.position = "none")      
    dfradar1 <- cbind(substring(file,11), dfradar1)
    dfradar <- rbind(dfradar, dfradar1)
  }  
  # if the merged dataset doesn't exist, create it
  if (!exists("dfradar")){
    radarfile <- read.table(file, header=TRUE, sep="\t")
    radarfile1 <- as.data.frame(as.numeric(radarfile[,3]))
    rownames(radarfile1) <- c(1:nrow(radarfile))
    dfradar <- ggradar(t(radarfile1), group.point.size = 1, grid.line.width = 0, grid.max = 1, grid.mid = 0, 
                        grid.min = 0, axis.line.colour = "white", axis.label.size = 0, grid.label.size = 0, 
                        centre.y = 0, background.circle.colour = "white", group.colours = "black", group.line.width = 0.5) + 
                theme(legend.position = "none")
    dfradar <- cbind(substring(file,11), dfradar)
    rm(radarfile)
    rm(radarfile1)
  }
} }

现在，当我想要保存坟墓时，我不能;我明白了：

“mutate_impl（.data，dots）中的错误：评估错误：尝试申请无功能。“

或：

“plot_clone（plot）中的错误：尝试应用非功能”

# merge the df with another df containing all other 
# variables that I wanna use in my scatterplot
dfradar_merge <- merge(dfradar, Cases, all=FALSE)
dfradar_merge <-  dfradar_merge %>% mutate(radargrobs = list(annotation_custom(ggplotGrob(radarplots)), 
xmin = as.numeric(Gender), xmax = as.numeric(Gender)*1.2, 
ymin = as.numeric(Age) , ymax = as.numeric(Age)*1.2)))

我想如果我能直接得到这个部分并将变量作为xmin和ymin传递，我应该能够做我需要的......

任何想法都非常感谢。这对我来说很头疼。

Answer 1

我提出了以下想法。我使用ggradar包来创建图形。然后，我查看了使用ggplot_build()保留在图形后面的数据框。似乎图形背后有13个列表。我需要调查哪个列表是包含多边形数据的正确列表。我发现第6个列表是您要提取并保存以供将来使用的列表。让我告诉你我做了什么。

library(dplyr)
library(ggradar)
library(scales)

# I modified the code from https://github.com/ricardo-bion/ggradar to get a graphic.

mtcars %>%
mutate_all(rescale) %>%
mutate(group = rownames(mtcars)) %>%
slice(5:9) %>%
select(1:4) -> mtcars_radar

g <- ggradar(mtcars_radar)

上面的代码生成以下图形。我的电脑或其他东西有问题，我看不到完整的图形。但这不是这个问题的问题。

现在，我们希望将数据保留在图形之后并寻找正确的数据。

foo <- ggplot_build(g)$data

# This is the 6th list in foo.

 $ :'data.frame':   20 obs. of  8 variables:
  ..$ colour  : chr [1:20] "#FF5A5F" "#FF5A5F" "#FF5A5F" "#FF5A5F" ...
  ..$ x       : num [1:20] 0 0.72 -0.687 0 0 ...
  ..$ y       : num [1:20] 1.111 -0.416 -0.397 1.111 0.611 ...
  ..$ group   : atomic [1:20] 1 1 1 1 2 2 2 2 3 3 ...
  .. ..- attr(*, "n")= int 5
  ..$ PANEL   : Factor w/ 1 level "1": 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
  ..$ size    : num [1:20] 1.5 1.5 1.5 1.5 1.5 1.5 1.5 1.5 1.5 1.5 ...
  ..$ linetype: num [1:20] 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ...
  ..$ alpha   : logi [1:20] NA NA NA NA NA NA ...

您想要将此列表提取为数据框。我之所以能够发现这个列表的原因是我关注的是颜色信息（例如，FF5A5F）。

mydf <- foo[[6]]

    colour          x          y group PANEL size linetype alpha
1  #FF5A5F  0.0000000  1.1111111     1     1  1.5        1    NA
2  #FF5A5F  0.7203077 -0.4158698     1     1  1.5        1    NA
3  #FF5A5F -0.6868360 -0.3965450     1     1  1.5        1    NA
4  #FF5A5F  0.0000000  1.1111111     1     1  1.5        1    NA
5  #FFB400  0.0000000  0.6111111     2     1  1.5        1    NA
6  #FFB400  0.4286803 -0.2474987     2     1  1.5        1    NA
7  #FFB400 -0.2584135 -0.1491951     2     1  1.5        1    NA
8  #FFB400  0.0000000  0.6111111     2     1  1.5        1    NA
9  #007A87  0.0000000  1.1111111     3     1  1.5        1    NA
10 #007A87  0.7203077 -0.4158698     3     1  1.5        1    NA
11 #007A87 -0.4726248 -0.2728700     3     1  1.5        1    NA
12 #007A87  0.0000000  1.1111111     3     1  1.5        1    NA
13 #8CE071  0.0000000  0.1111111     4     1  1.5        1    NA
14 #8CE071  0.2467912 -0.1424850     4     1  1.5        1    NA
15 #8CE071 -0.2278119 -0.1315273     4     1  1.5        1    NA
16 #8CE071  0.0000000  0.1111111     4     1  1.5        1    NA
17 #7B0051  0.0000000  0.1111111     5     1  1.5        1    NA
18 #7B0051  0.2595364 -0.1498434     5     1  1.5        1    NA
19 #7B0051 -0.1268266 -0.0732234     5     1  1.5        1    NA
20 #7B0051  0.0000000  0.1111111     5     1  1.5        1    NA

让我们确认这些数据是否会再现ggradar图形中的五个三角形。

gg <- ggplot(data = mydf, aes(x = x, y = y, group = group, color = factor(group))) +
      geom_path(show.legend = FALSE) +
      theme_bw()

总之，您希望破解ggplot数据以提取所需的数据。此方法允许您保存所需“形状”的数据。我希望这就是你所追求的。

使用雷达/极坐标图来描绘各个数据点

1 个答案: