Question

好吧，我正在为学校做一个小项目，一个6帧翻译。我不会详细介绍，我只会描述我想要添加的内容。正常输出将是：

TTCPTISPALGLAWS_DLGTLGFMSYSANTASGETLVSLYQLGLFEM_VVSYGRTKYYLICP_LFHLSVGFVPSD

这个字符串的重要部分是M和_（起始和终止密码子，生物学的东西）。我想做的是像这样强调这些：

TTCPTISPALGLAWS_DLGTLGF 'MSYSANTASGETLVSLYQLGLFEM_' VVSYGRTKYYLICP_LFHLSVGFVPSD

现在这里（对我而言）它变得棘手，我的输出看起来像这样（添加空格和'以突出显示开始和停止）。但它只做了一次，对于第一次开始和停止它发现。如果还有其他M ....._组合，则不会突出显示它们。

这是我当前的代码，尝试不止一次突出显示：

def start_stop(translation):
index_2 = 0
while True:
    if 'M' in translation[index_2::1]:
        index_1 = translation[index_2::1].find('M')
        index_2 = translation[index_1::1].find('_') + index_1
        new_translation = translation[:index_1] + " '" + \
                          translation[index_1:index_2 + 1] + "' " +\
                          translation[index_2 + 1:]
    else:
        break
    return new_translation

我真的以为这会做到，猜不是。所以现在我发现自己被卡住了。如果你们中的任何人愿意尝试和帮助，这里是一个随机生成的字符串，其中包含多个M ....._集：

'TTCPTISPALGLAWS_DLGTLGFMSYSANTASGETLVSLYQLGLFEM_VVSYGRTKYYLICP_LFHLSVGFVPSDGRRLTLYMPPARRLATKSRFLTPVISSG_DKPRHNPVARSQFLNPLVRPNYSISASKSGLRLVLSYTRLSLGINSLPIERLQYSVPAPAQITP_IPEHGNARNFLPEWPRLLISEPAPSVNVPCSVFVVDPEHPKAHSKPDGIANRLTFRWRLIG_VFFHNAL_VITHGYSRVDILLPVSRALHVHLSKSLLLRSAWFTLRNTRVTGKPQTSKT_FDPKATRVHAIDACAE_QQH_PDSGLRFPAPGSCSEAIRQLMI'

感谢愿意提供帮助的任何人：）

Answer 1

正则表达式非常方便：

import re
sequence = "TTCP...."
highlighted = re.sub(r"(M\w*?_)", r" '\1' ", sequence)

# Output:
"TTCPTISPALGLAWS_DLGTLGF 'MSYSANTASGETLVSLYQLGLFEM_' VVSYGRTKYYLICP_LFHLSVGFVPSDGRRLTLY 'MPPARRLATKSRFLTPVISSG_' DKPRHNPVARSQFLNPLVRPNYSISASKSGLRLVLSYTRLSLGINSLPIERLQYSVPAPAQITP_IPEHGNARNFLPEWPRLLISEPAPSVNVPCSVFVVDPEHPKAHSKPDGIANRLTFRWRLIG_VFFHNAL_VITHGYSRVDILLPVSRALHVHLSKSLLLRSAWFTLRNTRVTGKPQTSKT_FDPKATRVHAIDACAE_QQH_PDSGLRFPAPGSCSEAIRQLMI"

正则表达式解释：
我们寻找M后跟任意数量的＆＃34;字符＆＃34; \w*然后是_，使用?使其成为非贪婪的匹配（否则它只会从第一个M到最后一个{{1 }}）。
替换是匹配的组（_表示＆＃34;第一组＆＃34;，只有一个），但被空格和引号包围。

Answer 2

您只需要一小部分“切片”模块，您不需要任何外部模块：

Python字符串有一个名为'index'的方法，只需使用它。

string_1='TTCPTISPALGLAWS_DLGTLGFMSYSANTASGETLVSLYQLGLFEM_VVSYGRTKYYLICP_LFHLSVGFVPSD'

before=string_1.index('M')
after=string_1[before:].index('_')
print('{}  {} {}'.format(string_1[:before],string_1[before:before+after+1],string_1[before+after+1:]))

输出：

TTCPTISPALGLAWS_DLGTLGF  MSYSANTASGETLVSLYQLGLFEM_ VVSYGRTKYYLICP_LFHLSVGFVPSD

Python在字符串中插入空格

2 个答案: