Question

我运行了一个物流混合模型，需要大约3个小时来适应。我将模型保存为我的全局环境中的对象，我想在R markdown文档中包含模型摘要。但是，我不希望knitr在将html放在一起时运行模型（这将需要3个小时才能运行）。我只想打印我已经运行的模型的摘要。

Knitr抛出一个错误，说模型对象不在其范围内。

如何让knitr访问我已创建的模型对象，而不是在编译文档时重新运行模型？

Answer 1

我将模型保存为RDS对象，然后将其加载到RMarkdown文档中。然后，您可以加载RDS对象，同时如果您只想显示您运行的代码，则隐藏此事实。例如，请参阅下面的代码，该代码适合并保存/重新加载线性模型：

fit <- lm(x ~ y)
saveRDS(fit, "fit.RDS")

然后，在RMarkdown文档中

## (if you do not wish to hide the fact that you are loading it, then omit `echo = FALSE`)
```{r, echo = FALSE}
fit <- readRDS("fit.RDS")
## To show the code that fit the model. 
## `eval = FALSE` means the code is not run while knitting.
```{r, eval = FALSE}
fit <- lm(x ~ y)
```

Answer 2

首先要做的是用ls（）检查你的工作区。如果模型不存在，则需要重新运行它。如果您确实看到它，则只需在控制台中打印摘要即可。当您尝试编织文档时，它将要运行整个rmd

在没有运行模型的情况下在R markdown中打印模型摘要

2 个答案: