使用文件名中的日期文本作为新列读取多个csv数据集

时间:2017-12-01 03:58:31

标签: r csv readr

我有多个要导入R的csv文件。

如何将多个文件读入R并在第一列中添加一个带有文件名日期文本的列?

需要:

对于每个csv文件,请在文件名中找到日期,然后将其添加为每个数据帧的第一列,然后再进行rbinding。

enter image description here

以下是文件名中没有日期列的代码:

all <- lapply(c("file_10-16-2017.csv",
                "file_10-17-2017.csv",
                "file_10-18-2017.csv",
               function(x){
               read_csv(x, skip = 10)}) %>% bind_rows()

我希望我的最终结果看起来像这样:

Date_Pulled      Week         Date      spot1      Site ID test 
 10-16-2017  10/15/17   10/16/2017      trial          trial134
     .           .           .             .              .
     .           .           .             .              .
     .           .           .             .              .
 10-17-2017  10/15/17   10/16/2017      trial          trial134
     .           .           .             .              .
     .           .           .             .              .
     .           .           .             .              .

任何帮助都会很棒,谢谢!

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

首先,将要读取的所有文件放入单独的工作目录中,然后将工作目录更改为此目录。

# 1. change wd
setwd('new_file_path')

# 2. get files from that directory
my_files <- list.files()

# 3. read in all files, skipping first 10 lines
library(readr)
dat_list <- lapply(my_files, read_csv, skip = 10)

# 4. mutate a new column, which is the name of the file
library(dplyr)
dat_list_new <- lapply(dat_list, function(x) {
    mutate(x,
           new_col_one = names(x))
})

# 5. port this list of data frames to the global environment
names(dat_list_new) <- my_files # set the names of the dataframes
list2env(dat_list_new,envir=.GlobalEnv)

答案 1 :(得分:0)

我能够提出另一种方法:

filenames <- list.files(path = ".", pattern = NULL, all.files = FALSE, full.names = FALSE, recursive = FALSE, ignore.case = FALSE)

read_csv_filename <- function(filenames){
  ret <- read.csv(filenames, skip = 10)
  ret$Source <- filenames #EDIT
  ret
}

import.list <- ldply(filenames, read_csv_filename)

这应该可以解决问题