在anaconda安装simpleitk

Question

我使用命令在anaconda中安装了simpleitk conda install -c simpleitk simpleitk然后跟着链接https://github.com/SimpleITK/SimpleITKCondaRecipe构建它，但它没有连接到itk.org来构建。 导入SimpleITK作为jupyter笔记本上的sitk正在工作，但sitk.show（）无效。此外，当我试图遵循http://insightsoftwareconsortium.github.io/SimpleITK-Notebooks/Python_html/00_Setup.html的命令时， 从downloaddata import fetch_data，fetch_data_all无效。 甚至命令fetch_data_all（os.path.join（＆＃39; ..＆＃39;，＆＃39; Data＆＃39;），os.path.join（＆＃39; ..＆＃39;，＆ ＃39;数据＆＃39;，＆＃39; manifest.json＆＃39;））无效。我对simpleitk很新，不知道是否是由于构建未处理。请告诉我如何解决我的问题。我已经尝试了很多天，帮助我。而且如何将imagej作为simpleitk的默认值。我知道很多问题但如果解决了我会很高兴。

Answer 1

您似乎遇到了多个问题，所有问题都与安装工作环境有关，而且与SimpleITK不太相关。

1. 您使用conda install命令安装了SimpleITK，因此无需使用conda build命令构建它。检查您是否正确安装了它并查看您拥有的版本：

   import SimpleITK as sitk print(sitk.Version())

2. 函数fetch_data和fetch_data_all是module found in the SimpleITK notebooks repository的一部分。要使用该存储库中的代码，您需要使用git：

克隆它

git clone https://github.com/InsightSoftwareConsortium/SimpleITK-Notebooks.git

然后您可以运行笔记本或将相关模块复制到您的目录并在那里使用它们。

1. sitk.Show（）命令假设您安装了ImageJ/Fiji程序，这可能是它无法正常工作的原因（我猜这里没有提供足够的细节）。