Question

我有一个如下的数据文件。

Index   Code    Pos1    Strand  Chr2    Pos2    length  blocks
1   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  62739   47+9-   Vu01(old4)  63651   790 0
2   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  441403  10+0-   Vu01(old4)  446263  4893    0
3   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  450546  15+0-   Vu01(old4)  451091  576 0
4   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  459741  10+0-   Vu01(old4)  460841  1068    0
5   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  612262  14+0-   Vu01(old4)  629013  16788   0
6   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  688380  23+0-   Vu01(old4)  693207  4872    0
7   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  730643  12+0-   Vu01(old4)  740497  7011    0
8   G32_bkd.ctx:Vu01(old4)  834116  16+1-   Vu01(old4)  835797  1752    0

我想单独读取标题行，然后读取for循环中的每一行。我的代码是

with open(file) as f:
    title_line = f.readline()
    for line in f:
        line = line.strip()
        cols = line.split()

当我在print(line)循环中检查for时，它不会打印任何内容。但是当我检查print(title_line)时，将打印整个文件，保留文件中的确切格式。什么地方出了错？

N.B。所以，我只是复制并粘贴了整个文件，并以不同的名称保存，它工作得很好。

Answer 1

假设您有一个文件＆＃39; yourfile.txt＆＃39;它的大小不大。

f = open('yourfile.txt','r')

在readlines中跳过title_line。

for line in f.readlines()[1:]:
    line = line.strip()
    cols = line.split()
    # output the result
    print ",".join(x for x in cols)

Answer 2

可能导致该行为的一件事是，如果Python出于某种原因不喜欢原始文件中的行结束。

要确认这一点，在Linux上您可以使用od -t a file | less，并检查其中的内容。也许该文件符合不同的操作系统标准？如果不在Linux上，您可以使用Python本身打印ord的每个字符以查看其使用的内容（\ n，\ r，\ r \ n）。

如果是这样的话，你有一些选择：

对于Python 2，您可以在通用换行符模式下打开该文件。也就是说，＆＃34; U＆＃34;：
- open (file, "U")
- 这是一个快速简便的方法来确认这确实是问题并修复它，但不建议长期使用
否则，您可以使用io.open代替open，并使用其newline=参数。默认值None应该是您所需要的。

如果这不能解决您的问题，请提供：

您正在使用的操作系统
您正在使用的Python版本
原始文件的源操作系统

作为一个不相关的附注，我建议您查看Python的内置csv模块来阅读您的文件。它似乎是一个完美的契合（csv模块可以配置为使用空格或制表符，而不是逗号）

<强>参考

Python将整个文件作为一行读取

2 个答案: