在R错误中fread:mmap' d区域末尾有EOF

时间:2017-11-28 17:17:55

标签: r fread

我使用以下内容:

library(data.table)
dat1 <- fread('https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/00279/SUSY.csv.gz')

这是结果(等待一段时间后):

% Total    % Received % Xferd  Average Speed   Time    Time     Time  Current
                                 Dload  Upload   Total   Spent    Left  Speed
  0     0    0     0    0     0      0      0 --:--:-- --:--:-- --:--:--     0  0     0    0     0    0     0      0      0 --:--:-- --:--:-- --:--:--     0  0  879M    0  128k    0     0  68302      0  3:45:04  0:00:01  3:45:03 68876  0  879M    0  880k    0     0   292k      0  0:51:22  0:00:03  0:51:19  293k  0  879M    0 1888k    0     0   493k      0  0:30:23  0:00:03  0:30:20  496k  0  879M    0 2832k    0     0   583k      0  0:25:43  0:00:04  0:25:39  585k  0  879M    0 3872k    0     0   656k      0  0:22:51  0:00:05  0:22:46  770k  0  879M    0 4928k    0     0   709k      0  0:21:08  0:00:06  0:21:02  955k  0  879M    0 5904k    0     0   755k      0  0:19:52  0:00:07  0:19:45 1045k  0  879M    0 6816k    0     0   773k      0  0:19:24  0:00:08  0:19:16  987k  0  879M    0 7904k    0     0   801k      0  0:18:43  0:00:09  0:18:34 1012k  1  879M    1 9040k    0     0   828k      0  0:18:06  0:00:10  0:17:56 1031k  1  879M    1 10.0M    0     0   872k      0  0:17:12  0:00:11  0:17:01 1104k  1  879M    1 11.3M    0     0   905k      0  0:16:34  0:00:12  0:16:22 1140k  1  879M    1 12.8M    0     0   952k      0  0:15:45  0:00:13  0:15:32 1267k  1  879M    1 14.9M    0     0  1026k      0  0:14:37  0:00:14  0:14:23 1468k  1  879M    1 17.4M    0     0  1123k      0  0:13:22  0:00:15  0:13:07 1761k  2  879M    2 20.4M    0     0  1245k      0  0:12:03  0:00:16  0:11:47 2124k  2  879M    2 23.8M    0     0  1369k      0  0:10:57  0:00:17  0:10:40 2560k  3  879M    3 28.6M    0     0  1547k      0  0:09:42  0:00:18  0:09:24 3154k  3  879M    3 32.9M    0     0  1703k      0  0:08:48  0:00:19  0:08:29 3745k  4  879M    4 37.0M    0     0  1822k      0  0:08:14  0:00:20  0:07:54 4102k  4  879M    4 41.4M    0     0  1944k      0  0:07:43  0:00:21  0:07:22 4301k  5  879M    5 46.4M    0     0  2081k      0  0:07:12  0:00:22  0:06:50 4605k  5  879M    5 51.7M    0     0  2216k      0  0:06:46  0:00:23  0:06:23 4790k  6  879M    6 56.7M    0     0  2342k      0  0:06:24  0:00:24  0:06:00 4872k  7  879M    7 61.7M    0     0  2449k      0  0:06:07  0:00:25  0:05:42 5058k  7  879M    7 66.9M    0     0  2557k      0  0:05:52  0:00:26  0:05:26 5226k  8  879M    8 72.4M    0     0  2663k      0  0:05:38  0:00:27  0:05:11 5313k  8  879M    8 77.6M    0     0  2758k      0  0:05:26  0:00:28  0:04:58 5380k  9  879M    9 82.7M    0     0  2841k      0  0:05:17  0:00:29  0:04:48 5320k 10  879M   10 88.0M    0     0  2924k      0  0:05:07  0:00:30  0:04:37 5381k 10  879M   10 93.5M    0     0  3009k      0  0:04:59  0:00:31  0:04:28 5421k 11  879M   11 99.1M    0     0  3092k      0  0:04:51  0:00:32  0:04:19 5498k 11  879M   11  104M    0     0  3170k      0  0:04:44  0:00:33  0:04:11 5541k 12  879M   12  110M    0     0  3254k      0  0:04:36  0:00:34  0:04:02 5712k 13  879M   13  117M    0     0  3350k      0  0:04:28  0:00:35  0:03:53 5968k 14  879M   14  124M    0     0  3454k      0  0:04:20  0:00:36  0:03:44 6302k 14  879M   14  131M    0     0  3564k      0  0:04:12  0:00:37  0:03:35 6669k 15  879M   15  140M    0     0  3693k      0  0:04:03  0:00:38  0:03:25 7240k 16  879M   16  149M    0     0  3844k      0  0:03:54  0:00:39  0:03:15 7958k 18  879M   18  159M    0     0  3995k      0  0:03:45  0:00:40  0:03:05 8628k 18  879M   18  160M    0     0  3884k      0  0:03:51  0:00:42  0:03:09 6832k 18  879M   18  160M    0     0  3831k      0  0:03:55  0:00:42  0:03:13 5847k 18  879M   18  160M    0     0  3749k      0  0:04:00  0:00:43  0:03:17 4178k 18  879M   18  160M    0     0  3667k      0  0:04:05  0:00:44  0:03:21 2276k 18  879M   18  160M    0     0  3582k      0  0:04:11  0:00:45  0:03:26  304k 18  879M   18  162M    0     0  3545k      0  0:04:14  0:00:46  0:03:28  462k 18  879M   18  163M    0     0  3493k      0  0:04:17  0:00:47  0:03:30  608k 18  879M   18  164M    0     0  3443k      0  0:04:21  0:00:48  0:03:33  784k 18  879M   18  165M    0     0  3398k      0  0:04:25  0:00:49  0:03:36 1016k 18  879M   18  167M    0     0  3365k      0  0:04:27  0:00:50  0:03:37 1312k 19  879M   19  168M    0     0  3323k      0  0:04:31  0:00:51  0:03:40 1242k 19  879M   19  169M    0     0  3284k      0  0:04:34  0:00:52  0:03:42 1293k 19  879M   19  170M    0     0  3246k      0  0:04:37  0:00:53  0:03:44 1328k 19  879M   19  172M    0     0  3211k      0  0:04:40  0:00:54  0:03:46 1350k 19  879M   19  173M    0     0  3184k      0  0:04:42  0:00:55  0:03:47 1342k 19  879M   19  175M    0     0  3152k      0  0:04:45  0:00:56  0:03:49 1395k 20  879M   20  176M    0     0  3125k      0  0:04:48  0:00:57  0:03:51 1458k 20  879M   20  178M    0     0  3104k      0  0:04:50  0:00:58  0:03:52 1576k 20  879M   20  180M    0     0  3094k      0  0:04:51  0:00:59  0:03:52 1774k 20  879M   20  183M    0     0  3084k      0  0:04:52  0:01:00  0:03:52 1964k 21  879M   21  186M    0     0  3085k      0  0:04:51  0:01:01  0:03:50 2325k 21  879M   21  190M    0     0  3100k      0  0:04:50  0:01:02  0:03:48 2801k 22  879M   22  195M    0     0  3128k      0  0:04:47  0:01:03  0:03:44 3424k 22  879M   22  200M    0     0  3156k      0  0:04:45  0:01:04  0:03:41 3883k 23  879M   23  205M    0     0  3193k      0  0:04:42  0:01:05  0:03:37 4515k 23  879M   23  210M    0     0  3227k      0  0:04:39  0:01:06  0:03:33 4993k 24  879M   24  215M    0     0  3259k      0  0:04:36  0:01:07  0:03:29 5307k 25  879M   25  221M    0     0  3296k      0  0:04:33  0:01:08  0:03:25 5442k 25  879M   25  227M    0     0  3337k      0  0:04:29  0:01:09  0:03:20 5738k 26  879M   26  233M    0     0  3383k      0  0:04:26  0:01:10  0:03:16 5900k 27  879M   27  240M    0     0  3424k      0  0:04:23  0:01:11  0:03:12 6047k 27  879M   27  246M    0     0  3462k      0  0:04:20  0:01:12  0:03:08 6208k 28  879M   28  252M    0     0  3501k      0  0:04:17  0:01:13  0:03:04 6322k 29  879M   29  258M    0     0  3543k      0  0:04:14  0:01:14  0:03:00 6389k 30  879M   30  265M    0     0  3581k      0  0:04:11  0:01:15  0:02:56 6376k 30  879M   30  271M    0     0  3616k      0  0:04:09  0:01:16  0:02:53 6384k 31  879M   31  277M    0     0  3653k      0  0:04:06  0:01:17  0:02:49 6439k 32  879M   32  284M    0     0  3693k      0  0:04:03  0:01:18  0:02:45 6522k 33  879M   33  290M    0     0  3732k      0  0:04:01  0:01:19  0:02:42 6582k 33  879M   33  297M    0     0  3771k      0  0:03:58  0:01:20  0:02:38 6666k 34  879M   34  305M    0     0  3817k      0  0:03:55  0:01:21  0:02:34 6891k 35  879M   35  312M    0     0  3867k      0  0:03:52  0:01:22  0:02:30 7191k 36  879M   36  319M    0     0  3906k      0  0:03:50  0:01:23  0:02:27 7266k 37  879M   37  325M    0     0  3932k      0  0:03:49  0:01:24  0:02:25 7134k 37  879M   37  330M    0     0  3945k      0  0:03:48  0:01:25  0:02:23 6742k 38  879M   38  335M    0     0  3959k      0  0:03:47  0:01:26  0:02:21 6291k 38  879M   38  340M    0     0  3974k      0  0:03:46  0:01:27  0:02:19 5750k 39  879M   39  346M    0     0  3993k      0  0:03:45  0:01:28  0:02:17 5450k 40  879M   40  351M    0     0  4012k      0  0:03:44  0:01:29  0:02:15 5368k 40  879M   40  357M    0     0  4030k      0  0:03:43  0:01:30  0:02:13 5488k 41  879M   41  361M    0     0  4032k      0  0:03:43  0:01:31  0:02:12 5301k 41  879M   41  364M    0     0  4022k      0  0:03:43  0:01:32  0:02:11 4853k 41  879M   41  367M    0     0  4006k      0  0:03:44  0:01:33  0:02:11 4237k 42  879M   42  369M    0     0  3992k      0  0:03:45  0:01:34  0:02:11 3635k 42  879M   42  371M    0     0  3970k      0  0:03:46  0:01:35  0:02:11 2887k 42  879M   42  373M    0     0  3950k      0  0:03:48  0:01:36  0:02:12 2442k 42  879M   42  375M    0     0  3930k      0  0:03:49  0:01:37  0:02:12 2233k 42  879M   42  377M    0     0  3911k      0  0:03:50  0:01:38  0:02:12 2134k 43  879M   43  379M    0     0  3893k      0  0:03:51  0:01:39  0:02:12 2009k 43  879M   43  381M    0     0  3875k      0  0:03:52  0:01:40  0:02:12 2051k 43  879M   43  383M    0     0  3858k      0  0:03:53  0:01:41  0:02:12 2073k 43  879M   43  385M    0     0  3840k      0  0:03:54  0:01:42  0:02:12 2086k 44  879M   44  387M    0     0  3825k      0  0:03:55  0:01:43  0:02:12 2118k 44  879M   44  390M    0     0  3811k      0  0:03:56  0:01:44  0:02:12 2172k 44  879M   44  392M    0     0  3799k      0  0:03:57  0:01:45  0:02:12 2272k 44  879M   44  395M    0     0  3790k      0  0:03:57  0:01:46  0:02:11 2413k 45  879M   45  398M    0     0  3785k      0  0:03:57  0:01:47  0:02:10 2647k 45  879M   45  402M    0     0  3786k      0  0:03:57  0:01:48  0:02:09 2971k 46  879M   46  406M    0     0  3792k      0  0:03:57  0:01:49  0:02:08 3394k 46  879M   46  411M    0     0  3805k      0  0:03:56  0:01:50  0:02:06 3933k 47  879M   47  417M    0     0  3827k      0  0:03:55  0:01:51  0:02:04 4610k 48  879M   48  425M    0     0  3859k      0  0:03:53  0:01:52  0:02:01 5447k 49  879M   49  433M    0     0  3903k      0  0:03:50  0:01:53  0:01:57 6454k 50  879M   50  443M    0     0  3958k      0  0:03:47  0:01:54  0:01:53 7603k 50  879M   50  444M    0     0  3928k      0  0:03:49  0:01:55  0:01:54 6608k 50  879M   50  446M    0     0  3909k      0  0:03:50  0:01:56  0:01:54 5701k 50  879M   50  446M    0     0  3871k      0  0:03:52  0:01:58  0:01:54 4135k 50  879M   50  446M    0     0  3850k      0  0:03:53  0:01:58  0:01:55 2646k 50  879M   50  447M    0     0  3796k      0  0:03:57  0:02:00  0:01:57  623k 50  879M   50  447M    0     0  3768k      0  0:03:58  0:02:01  0:01:57  512k 50  879M   50  447M    0     0  3756k      0  0:03:59  0:02:01  0:01:58  208k 51  879M   51  449M    0     0  3744k      0  0:04:00  0:02:02  0:01:58  524k 51  879M   51  449M    0     0  3718k      0  0:04:02  0:02:03  0:01:59  606k 51  879M   51  450M    0     0  3693k      0  0:04:03  0:02:04  0:01:59  760k 51  879M   51  451M    0     0  3669k      0  0:04:05  0:02:05  0:02:00  934k 51  879M   51  452M    0     0  3651k      0  0:04:06  0:02:06  0:02:00 1009k 51  879M   51  453M    0     0  3629k      0  0:04:08  0:02:07  0:02:01  805k 51  879M   51  454M    0     0  3607k      0  0:04:09  0:02:08  0:02:01  872k 51  879M   51  455M    0     0  3586k      0  0:04:11  0:02:09  0:02:02  917k 51  879M   51  456M    0     0  3569k      0  0:04:12  0:02:10  0:02:02  959k 51  879M   51  456M    0     0  3548k      0  0:04:13  0:02:11  0:02:02  949k 52  879M   52  457M    0     0  3529k      0  0:04:15  0:02:12  0:02:03  981k 52  879M   52  459M    0     0  3511k      0  0:04:16  0:02:13  0:02:03 1044k 52  879M   52  460M    0     0  3495k      0  0:04:17  0:02:14  0:02:03 1159k 52  879M   52  462M    0     0  3485k      0  0:04:18  0:02:15  0:02:03 1278k 52  879M   52  464M    0     0  3475k      0  0:04:19  0:02:16  0:02:03 1551k 53  879M   53  466M    0     0  3467k      0  0:04:19  0:02:17  0:02:02 1831k 53  879M   53  469M    0     0  3460k      0  0:04:20  0:02:18  0:02:02 2067k 53  879M   53  471M    0     0  3452k      0  0:04:20  0:02:19  0:02:01 2245k 53  879M   53  473M    0     0  3446k      0  0:04:21  0:02:20  0:02:01 2389k 54  879M   54  476M    0     0  3441k      0  0:04:21  0:02:21  0:02:00 2513k 54  879M   54  479M    0     0  3436k      0  0:04:22  0:02:22  0:02:00 2599k 54  879M   54  482M    0     0  3434k      0  0:04:22  0:02:23  0:01:59 2703k 55  879M   55  485M    0     0  3429k      0  0:04:22  0:02:24  0:01:58 2788k 55  879M   55  487M    0     0  3425k      0  0:04:22  0:02:25  0:01:57 2850k 55  879M   55  490M    0     0  3421k      0  0:04:23  0:02:26  0:01:57 2873k 56  879M   56  493M    0     0  3419k      0  0:04:23  0:02:27  0:01:56 2909k 56  879M   56  496M    0     0  3415k      0  0:04:23  0:02:28  0:01:55 2880k 56  879M   56  499M    0     0  3414k      0  0:04:23  0:02:29  0:01:54 2965k 57  879M   57  503M    0     0  3413k      0  0:04:23  0:02:30  0:01:53 3070k 57  879M   57  506M    0     0  3416k      0  0:04:23  0:02:31  0:01:52 3259k 58  879M   58  510M    0     0  3419k      0  0:04:23  0:02:32  0:01:51 3421k 58  879M   58  514M    0     0  3427k      0  0:04:22  0:02:33  0:01:49 3767k 59  879M   59  520M    0     0  3439k      0  0:04:21  0:02:34  0:01:47 4204k 59  879M   59  526M    0     0  3457k      0  0:04:20  0:02:35  0:01:45 4790k 60  879M   60  531M    0     0  3470k      0  0:04:19  0:02:36  0:01:43 5099k 61  879M   61  536M    0     0  3482k      0  0:04:18  0:02:37  0:01:41 5397k 61  879M   61  542M    0     0  3498k      0  0:04:17  0:02:38  0:01:39 5673k 62  879M   62  548M    0     0  3515k      0  0:04:16  0:02:39  0:01:37 5895k 63  879M   63  554M    0     0  3533k      0  0:04:14  0:02:40  0:01:34 5900k 63  879M   63  561M    0     0  3552k      0  0:04:13  0:02:41  0:01:32 6134k 64  879M   64  568M    0     0  3573k      0  0:04:12  0:02:42  0:01:30 6448k 65  879M   65  574M    0     0  3593k      0  0:04:10  0:02:43  0:01:27 6632k 66  879M   66  581M    0     0  3612k      0  0:04:09  0:02:44  0:01:25 6717k 66  879M   66  588M    0     0  3632k      0  0:04:07  0:02:45  0:01:22 6820k 67  879M   67  595M    0     0  3652k      0  0:04:06  0:02:46  0:01:20 6894k 68  879M   68  601M    0     0  3671k      0  0:04:05  0:02:47  0:01:18 6878k 69  879M   69  608M    0     0  3690k      0  0:04:04  0:02:48  0:01:16 6884k 69  879M   69  615M    0     0  3710k      0  0:04:02  0:02:49  0:01:13 6923k 70  879M   70  622M    0     0  3731k      0  0:04:01  0:02:50  0:01:11 7001k 71  879M   71  629M    0     0  3752k      0  0:04:00  0:02:51  0:01:09 7079k 72  879M   72  637M    0     0  3774k      0  0:03:58  0:02:52  0:01:06 7233k 73  879M   73  643M    0     0  3791k      0  0:03:57  0:02:53  0:01:04 7145k 73  879M   73  650M    0     0  3808k      0  0:03:56  0:02:54  0:01:02 7131k 74  879M   74  654M    0     0  3811k      0  0:03:56  0:02:55  0:01:01 6573k 74  879M   74  659M    0     0  3817k      0  0:03:55  0:02:56  0:00:59 6067k 75  879M   75  664M    0     0  3824k      0  0:03:55  0:02:57  0:00:58 5544k 76  879M   76  669M    0     0  3831k      0  0:03:55  0:02:58  0:00:57 5247k 76  879M   76  674M    0     0  3838k      0  0:03:54  0:02:59  0:00:55 4904k 77  879M   77  679M    0     0  3845k      0  0:03:54  0:03:00  0:00:54 5038k 77  879M   77  684M    0     0  3853k      0  0:03:53  0:03:01  0:00:52 5109k 78  879M   78  689M    0     0  3860k      0  0:03:53  0:03:02  0:00:51 5146k 78  879M   78  694M    0     0  3867k      0  0:03:52  0:03:03  0:00:49 5144k 79  879M   79  699M    0     0  3874k      0  0:03:52  0:03:04  0:00:48 5163k 80  879M   80  704M    0     0  3882k      0  0:03:51  0:03:05  0:00:46 5224k 80  879M   80  709M    0     0  3891k      0  0:03:51  0:03:06  0:00:45 5282k 81  879M   81  715M    0     0  3900k      0  0:03:50  0:03:07  0:00:43 5365k 82  879M   82  721M    0     0  3911k      0  0:03:50  0:03:08  0:00:42 5539k 82  879M   82  727M    0     0  3925k      0  0:03:49  0:03:09  0:00:40 5822k 83  879M   83  734M    0     0  3942k      0  0:03:48  0:03:10  0:00:38 6153k 84  879M   84  742M    0     0  3961k      0  0:03:47  0:03:11  0:00:36 6584k 85  879M   85  750M    0     0  3985k      0  0:03:46  0:03:12  0:00:34 7148k 86  879M   86  759M    0     0  4014k      0  0:03:44  0:03:13  0:00:31 7907k 87  879M   87  767M    0     0  4033k      0  0:03:43  0:03:14  0:00:29 8059k 87  879M   87  773M    0     0  4046k      0  0:03:42  0:03:15  0:00:27 8025k 88  879M   88  779M    0     0  4055k      0  0:03:42  0:03:16  0:00:26 7657k 89  879M   89  785M    0     0  4066k      0  0:03:41  0:03:17  0:00:24 7198k 90  879M   90  791M    0     0  4078k      0  0:03:40  0:03:18  0:00:22 6528k 90  879M   90  797M    0     0  4089k      0  0:03:40  0:03:19  0:00:21 6292k 91  879M   91  804M    0     0  4100k      0  0:03:39  0:03:20  0:00:19 6224k 92  879M   92  810M    0     0  4112k      0  0:03:39  0:03:21  0:00:18 6345k 92  879M   92  816M    0     0  4124k      0  0:03:38  0:03:22  0:00:16 6440k 93  879M   93  823M    0     0  4136k      0  0:03:37  0:03:23  0:00:14 6455k 94  879M   94  829M    0     0  4147k      0  0:03:37  0:03:24  0:00:13 6480k 95  879M   95  835M    0     0  4159k      0  0:03:36  0:03:25  0:00:11 6503k 95  879M   95  842M    0     0  4171k      0  0:03:35  0:03:26  0:00:09 6560k 96  879M   96  849M    0     0  4183k      0  0:03:35  0:03:27  0:00:08 6580k 97  879M   97  855M    0     0  4197k      0  0:03:34  0:03:28  0:00:06 6683k 98  879M   98  862M    0     0  4209k      0  0:03:34  0:03:29  0:00:05 6732k 98  879M   98  868M    0     0  4216k      0  0:03:33  0:03:30  0:00:03 6555k 99  879M   99  873M    0     0  4225k      0  0:03:33  0:03:31  0:00:02 6438k100  879M  100  879M    0     0  4235k      0  0:03:32  0:03:32 --:--:-- 6413k
Error in fread("https://archive.ics.uci.edu/ml/machine-learning-databases/00279/SUSY.csv.gz") : 
  mmap'd region has EOF at the end

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

文件的内容可能是CSV或TSV格式,但在行尾没有最终的换行符。在Unix中,这通常是对任何文本文件的期望。大多数库可以处理,但有些不能。我在fread时遇到了同样的错误,最后遗漏的\n就是原因。